Projektbeschreibung
Chemical Space: Potenzial für die Arzneistoffforschung
Die meisten pharmakologischen Moleküle binden an Enzyme oder Rezeptorproteine, die wohldefinierte Bindungstaschen besitzen. Eine technische Herausforderung ist allerdings noch die Erzeugung niedermolekularer Wirkstoffe, die in Proteininteraktion eingreifen oder gegen Proteine mit flacher Oberfläche wirken. Das EU-finanzierte Projekt TARGET entwickelt eine automatisierte Plattform zur Identifizierung von Liganden, die an komplexe oder für Wirkstoffe unzugängliche Proteine binden. Indem Bibliotheken biologischer Substanzen (Peptide) mit chemischen Substanzbibliotheken kombiniert werden, soll der Chemical Space weiter erschlossen werden, um Kombinationen zu identifizieren, die an komplexe Proteintargets binden. Die Methode von TARGET könnte künftige Forschungen an zellgängigen Arzneistoffen unterstützen, die auf komplexe Proteine wirken.
Ziel
"Genome sequencing combined with powerful new research technologies has greatly expanded the number of potential drug targets, offering enormous opportunities to address unmet medical needs. However, for proteins with flat, featureless surfaces or for protein-protein interactions, it has been difficult to impossible to generate ligands based on classical small molecules, hindering their evaluation as targets and the development of drugs.
Herein, we propose a new method and its application for targeting the so-called ""undruggable"" proteins by tapping into a new chemical space, generated by ""merging"" biological and chemical compound libraries. In brief, millions of short cyclic peptides (46 amino acids) genetically encoded by phage display (generated with methods we established previously) will be expanded by combinatorially attaching via lateral groups > 1000 different chemical fragments in separate wells of microwell plates. We will develop a strategy that combines the elements of i) automation, ii) liquid transfer by acoustic dispensing, iii) single-round phage display panning, iv) ""phage PCR"" and a primer coding strategy, v) next-generation sequencing (NGS) and vi) computational sequence analysis to perform phage display selections with a library comprising > 1000 non-natural building blocks.
We expect that this technology will deliver ligands to challenging proteins and facilitate their evaluation as drug targets. The ligands are kept small on purpose, below one kDa, and the polarity is limited so that they are more likely to be cell permeable and so they may directly serve as leads for the generation of oral drugs.
"
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Virologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Sozialwissenschaften Soziologie industrielle Beziehungen Automatisierung
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2020-ADG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1015 LAUSANNE
Schweiz
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.