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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Mechanism, regulation and functions of genome folding through loop extrusion by cohesin-NIPBL

Description du projet

Repliement de l’ADN des chromosomes grâce à une extrusion assurée par le complexe cohésine

L’ADN a été découvert il y a 150 ans, mais le repliement de l’ADN dans les chromosomes reste un mystère. L’une des hypothèses avancées est que ce repliement s’effectue par un processus appelé extrusion en boucle, par lequel des ATPases à plusieurs sous-unités enroulent l’ADN génomique en boucles, rapprochant ainsi des loci éloignés. Une récente découverte a fourni la première preuve directe que le complexe protéique à plusieurs sous-unités associé aux chromosomes, la cohésine, extrude effectivement rapidement l’ADN en boucles. Le projet LoopMechRegFun, financé par l’UE, va utiliser un test d’extrusion de boucle à une seule molécule afin d’élucider les mécanismes d’extrusion de boucle par la cohésine et la manière dont ce processus se déroule dans les cellules vivantes. Les résultats du projet permettront de mieux comprendre l’architecture du génome et les mécanismes de régulation et de recombinaison des gènes.

Objectif

Since its discovery 150 years ago, DNA has been intensely studied. As a result, it is understood in some detail how genomic DNA is replicated, repaired and segregated, and entire genomes can be sequenced. However, how DNA is folded in chromosomes has remained a mystery. It has been proposed that this is achieved by a process called loop extrusion. This hypothesis proposes that SMC complexes, multi-subunit ATPases present in all kingdoms of life, reel genomic DNA into loops, thus bringing distant loci into proximity. This process is thought to have important structural and regulatory functions, such as the separation of bacterial genomes and the folding of eukaryotic DNA into loops and topologically associating domains (TADs), facilitating sister chromatid resolution, gene regulation and immunoglobulin gene recombination. We discovered recently that in vitro single molecules of the SMC complex cohesin bound to NIPBL (cohesin-NIPBL) indeed rapidly extrude DNA into loops at up to 2.1 kb/s. These results provided the first direct evidence for the hypothesis that cohesin generates chromatin loops and TADs by extrusion. However, the most fundamental questions relating to this process remain unanswered: What is the mechanism of loop extrusion? How is this process controlled? How does cohesin extrude chromatin fibers in cells, and how does this contribute to the processes mentioned above and to other functions? We are proposing to use our single-molecule loop extrusion assay and other techniques to address these questions. Answering these will be essential for understanding genome architecture and regulation, will provide insights into mechanisms of gene regulation and recombination, will reveal how SMC complexes function as molecular ‘motors’, and may provide insight into the etiology of human disorders caused by malfunctioning of cohesin and NIPBL, such as several widespread cancers, rare congenital ‘cohesinopathies’, and trisomies and spontaneous human abortions.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-ADG - Advanced Grant

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-ADG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 679 465,00
Adresse
CAMPUS-VIENNA-BIOCENTER 1
1030 Wien
Autriche

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Région
Ostösterreich Wien Wien
Type d’activité
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 679 465,00

Bénéficiaires (1)

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