Projektbeschreibung
Wurzelmikroben auf den Grund gegangen
Das Wurzelmikrobiom besitzt vielversprechende Eigenschaften, die Pestizide und Düngemittel ersetzen und die moderne Landwirtschaft revolutionieren könnten. Die bodenphysikochemische Komplexität und eine außerordentlich komplexe biotische Umwelt führen jedoch zu Hindernissen, die nur mit Methoden mit hoher räumlicher und zeitlicher Auflösung überwunden werden können. In Kombination mit synthetischen Bakteriengemeinschaften könnten solche Methoden ein mechanistisches Verständnis der Bakterienansiedlung in der Rhizosphäre ermöglichen. Vor diesem Hintergrund wird das EU-finanzierte Projekt ROOBABAA unterschiedliche, sich dynamisch entwickelnde Mikronischen für die bakterielle Besiedlung der Wurzel charakterisieren. Das Projekt wird sich in seiner Arbeit auf die umfassende Nutzung von fluoreszenten mikrobiellen Markerstämmen, die Beobachtung des bakteriellen Stoffwechsels und die Nachverfolgung von bakterieller Vermehrung und Taxien stützen. Dadurch werden die Forschenden die nötigen Erkenntnisse gewinnen, um mikrobielle Wirkstoffe mit Erfolg in der Landwirtschaft einsetzen zu können.
Ziel
Root microbiome research is motivated by the promise of using growth-promoting, disease-suppressive bacteria as transferable, protective agents in agriculture. Yet, such approaches have not realized their potential as pesticide or fertilizer alternatives. Major obstacle are soil physico-chemical complexity and a staggeringly complex biotic environment. Recent establishments of synthetic communities promise to enable mechanistic understanding of bacterial establishment in the rhizosphere. However, current methods crucially lack in spatial and temporal resolution. The root is an assembly of dynamically evolving, distinct micro-niches for bacterial colonization that I propose to characterize by extensive use of fluorescent microbial marker strains, monitoring of bacterial metabolism and tracing of proliferation and taxis. This is complemented by precise manipulations of root development. The fractal, open-growth of roots must result in rapid changes in nutrient composition and cycles of nutrient abundance and restriction, forcing bacteria to oscillate between different survival strategies. These fundamental aspects of micro-niche formation, change and collapse are largely undescribed, yet central to understand success or failure of bacterial colonization. I propose to visualize and dissect these processes by combining cutting-edge tools for visualization, optical and genetic manipulations of both plant and bacteria. Bacterial model systems will be inserted into defined bacterial culture collections and results from mono-associations will be challenged by soil-based gnotobiotic systems and high-resolution community profiling. This project will reveal central, dynamic aspects of bacteria-root interactions within a realistic, time-resolved framework of root development. This knowledge will be crucial for progressing to a mechanistic understanding of root bacteria interaction and the reliable use of bacterial agents in agriculture by predictive design of bacterial niches.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
- Agrarwissenschaften Landwirtschaft, Forstwirtschaft und Fischerei Landwirtschaft
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2020-ADG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1015 LAUSANNE
Schweiz
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.