Projektbeschreibung
Die für die Bildung von Lamina-assoziierten Domänen verantwortlichen Sequenzen
Lamina-assoziierte Domänen (LAD) bedecken 40 % des menschlichen Genoms und beherbergen Tausende transkriptionell unterdrückter Gene. Während die Erkennung Lamina-assoziierter Domänen und deren Verankerung an der Lamina streng reguliert werden müssen, um eine akute Genexpression zu gewährleisten, ist über die zugrunde liegenden Mechanismen wenig bekannt. Es ist bekannt, dass Lamina-assoziierte Domänen reich an A- und T-Nukleotiden sind, andere Sequenzdeterminanten sind jedoch nur unzureichend charakterisiert. Das EU-finanzierte Projekt I.am.a.LAD wird zunächst untersuchen, wie die Erkennung von Lamina-assoziierten Domänen mit ihrem A/T-Gehalt zusammenhängt. Zweitens wird der oder die im Rahmen des Marie-Skłodowska-Curie-Stipendiums Forschende ein Instrument für die Suche nach zusätzlichen Sequenzdeterminanten entwickeln. Abschließend werden Sequenzen identifiziert, welche die Bildung von Lamina-assoziierten Domänen vorantreiben, und die Rolle des Kohäsin-Komplexes in diesem Prozess aufklären.
Ziel
"Lamina-associated domains (LADs) are large chromatin domains anchored to a protein meshwork coating the inner nuclear envelope, the nuclear lamina (NL). They cover 40% of the human genome and hold thousands of transcriptionally repressed genes. While some LADs can be locally detached from the NL upon gene activation, others are constitutively at the NL. This implies that LAD recognition and anchoring to the NL has to be tightly regulated to ensure acute gene expression. However, little is known about mechanisms governing LAD recognition and targeting to the NL. LADs are known to be A and T nucleotide-rich, but other sequence determinants have remained poorly characterized so far. In this project I will (1) investigate whether LAD recognition is directly linked to their high A/T content and (2) develop a novel tool to search for additional sequence determinants. First, I will insert in the mouse genome long DNA stretches of varying A/T percentages and determine whether A/T-rich sequences preferentially associate with the NL. Second, I will develop an approach to randomly scramble a LAD sequence organization. This method relies on the recombination between LoxP sites randomly inserted by local ""hopping"" of a transposable element. After determining the effects of the resulting rearrangements on NL association and expression of the surrounding genes, I will identify sequences that drive LAD formation. Besides, the cohesin complex partitions the genome into topologically associated domains and hence has a major impact in genome 3D folding. At last, I will investigate cohesin’s role in LAD formation and remodeling after recombination. Altogether, this project will result in an unprecedented characterization of LAD biology, a deeper understanding of cohesin’s role in genome folding and set up a novel genome-scrambling technique with large applications in genome biology."
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Technik und Technologie Werkstofftechnik Fasern
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Technik und Technologie Werkstofftechnik Beschichtung
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2020
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1066 CX AMSTERDAM
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.