Descrizione del progetto
Le sequenze che guidano la formazione di LAD
I domini associati alla lamina (LAD, lamina-associated domain) coprono il 40 % del genoma umano e contengono migliaia di geni trascrizionalmente repressi. Sebbene il riconoscimento del LAD e l’ancoraggio alla lamina nucleare (LN) debbano essere strettamente regolati per garantire l’espressione genica acuta, poco si conosce sui meccanismi sottostanti. I LAD sono noti per essere ricchi di nucleotidi A e T, ma altri determinanti di sequenza sono scarsamente caratterizzati. Il progetto I.am.a.LAD finanziato dall’UE, esaminerà innanzitutto come il riconoscimento LAD sia collegato al loro contenuto in A/T. In secondo luogo, attraverso questa borsa di studio del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il borsista di ricerca svilupperà uno strumento per cercare ulteriori determinanti di sequenza. Infine, il borsista MSCA identificherà le sequenze che guidano la formazione di LAD e chiarirà il ruolo del complesso della coesina in questo processo.
Obiettivo
"Lamina-associated domains (LADs) are large chromatin domains anchored to a protein meshwork coating the inner nuclear envelope, the nuclear lamina (NL). They cover 40% of the human genome and hold thousands of transcriptionally repressed genes. While some LADs can be locally detached from the NL upon gene activation, others are constitutively at the NL. This implies that LAD recognition and anchoring to the NL has to be tightly regulated to ensure acute gene expression. However, little is known about mechanisms governing LAD recognition and targeting to the NL. LADs are known to be A and T nucleotide-rich, but other sequence determinants have remained poorly characterized so far. In this project I will (1) investigate whether LAD recognition is directly linked to their high A/T content and (2) develop a novel tool to search for additional sequence determinants. First, I will insert in the mouse genome long DNA stretches of varying A/T percentages and determine whether A/T-rich sequences preferentially associate with the NL. Second, I will develop an approach to randomly scramble a LAD sequence organization. This method relies on the recombination between LoxP sites randomly inserted by local ""hopping"" of a transposable element. After determining the effects of the resulting rearrangements on NL association and expression of the surrounding genes, I will identify sequences that drive LAD formation. Besides, the cohesin complex partitions the genome into topologically associated domains and hence has a major impact in genome 3D folding. At last, I will investigate cohesin’s role in LAD formation and remodeling after recombination. Altogether, this project will result in an unprecedented characterization of LAD biology, a deeper understanding of cohesin’s role in genome folding and set up a novel genome-scrambling technique with large applications in genome biology."
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- ingegneria e tecnologia ingegneria dei materiali fibre
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- ingegneria e tecnologia ingegneria dei materiali rivestimenti e pellicole
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione
Siamo spiacenti… si è verificato un errore inatteso durante l’esecuzione.
È necessario essere autenticati. La sessione potrebbe essere scaduta.
Grazie per il tuo feedback. Riceverai presto un'e-mail di conferma dell'invio. Se hai scelto di ricevere una notifica sullo stato della segnalazione, sarai contattato anche quando lo stato della segnalazione cambierà.
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bandoCoordinatore
Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1066 CX AMSTERDAM
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.