Descripción del proyecto
Estudio de vanguardia sobre los mecanismos de la memoria transcripcional
La memoria transcripcional es un fenómeno durante el cual las células preparadas con estímulos particulares muestran una mayor expresión génica tras la reestimulación en un momento posterior. Dicha memoria de los estados de expresión génica es esencial para el desarrollo y mantenimiento de los tejidos. El proyecto IMMUNE-GENEMEMO, financiado por las Acciones Marie Skłodowska-Curie, se basa en el descubrimiento de genes con una fuerte memoria transcripcional de activación previa de interferones γ (INF-γ), lo que crea una mayor proporción de células que expresan el gen diana. El objetivo del proyecto es identificar nuevos factores de mantenimiento de la memoria transcripcional en células humanas mediante una eficiente estrategia de citometría de alto rendimiento combinada con protocolos de mutagénesis CRISPR-Cas9 hologenómicos, y establecer el papel de estos componentes en la estabilidad de la identidad de las células dendríticas.
Objetivo
Memory of gene expression states is essential for development and maintenance of tissues. Chromatin, a protein DNA complex, is implicated in the process. Local, chromatin feedback loops are involved in maintenance of gene silencing, but analogous mechanisms for preservation of active states are unknown. In order to reveal feedback loops for active gene expression states it is crucial to uncouple them from ongoing transcription, as it occurs in the case of maintenance of silent states. Such partition takes place during trained immunity – memory of the innate immune system. A key paradigm is interferon gamma (IFNγ) stimulation. While IFNγ induces many genes, a subset of those is maintained in a poised, inactive state that allows for rapid re-activation at a later time – an event called transcriptional memory.
In my ongoing research I have discovered novel genes that show strong transcriptional memory of prior IFNγ activation and have obtained initial mechanistic insights into the role of chromatin in the process. Importantly, I discovered that memory results in a larger proportion of cells expressing the target gene. This forms the basis of a cell sorting, high throughput assay that I have developed. I am now in a unique position to capitalize on those discoveries and tools.
I aim to identify novel transcriptional memory maintenance factors in human cells using an unbiased approach based on an efficient cell selection strategy combined with genome wide, CRISPR-Cas9 mutagenesis protocols. Secondly I wish to establish the function of the identified components in the stability of dendritic cells identity after differentiation form monocytes.
The multidisciplinary and unique perspective of this project: combining gene expression analysis and selection strategies with immunological expertise will advance our understanding of the mechanisms underlying maintenance of gene expression states and contribute to the development of new immune therapies and vaccines.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular genética molecular
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas
- ciencias médicas y de la salud medicina básica inmunología
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2020
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
80-309 GDANSK
Polonia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.