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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Using comparative genomics to uncover the origins of phenotypic modularity in squamate reptiles

Description du projet

Diversité des crânes et des membres chez les squamates

Les éléments ultraconservés (UCE) sont des régions du génome qui affichent extrêmement peu de variations entre des organismes très éloignés les uns des autres. Beaucoup d’entre eux jouent un rôle essentiel dans le développement, en déterminant la morphologie. Lorsque les UCE sont éliminés, des modifications considérables peuvent apparaître au niveau du crâne et des membres des mammifères. Toutefois, le rôle causal joué par les UCE dans le développement n’a pas été entièrement étudié. À travers les UCE, le projet ULTRAMOD, financé par l’UE, caractérisera les paysages de séquences activatrices qui sont censées contribuer à la diversité des crânes et des membres chez les squamates (un ordre de reptiles). Le projet fera le lien entre, d’une part, la dynamique de ces paysages génomiques et, d’autre part, la modularité et l’intégration des crânes et des membres observés chez les squamates, en utilisant des données scannées en 3D dérivées de spécimens de musée et en produisant des données subgénomiques et 3D innovantes destinées à des référentiels en ligne.

Objectif

The genomic determinants of morphological change are of great interest to evolutionary biologists, particularly how they relate to the loss and evolution of key traits. Ultraconserved elements (UCEs) are regions of genomes that are highly conserved across distantly related organisms. Many UCEs are located in cis-regulatory (enhancer) regions of the genome that play critical developmental roles in determining morphology; when UCEs are removed notable changes to the skulls and limbs of mammals can occur. These UCEs are highly conserved across vertebrates and the evolutionary loss of a single UCE (Sonic hedgehog limb enhancer) has been associated with partial and complete limb loss in squamate reptiles. However, much of what is known about the causal role UCEs play in development is derived from functional studies, which have only examined a handful of model species. A broader phylogenetic and genomic perspective of how UCEs relate to morphological variation would offer much needed information for interpreting the results of functional studies. Comparative genomics offers a means to dramatically increase the taxonomic sampling of UCEs, both through examination of annotated genomes and comparison of UCE loci obtained using sub-genomic sampling methodologies. I will use UCEs to characterize the enhancer landscapes of squamate reptiles that putatively underpin cranial and limb diversity. I will then relate the dynamics of these genomic landscapes to the modularity and integration of crania and limbs that occur across squamates using 3-dimensional (3D) scan data derived from museum specimens. This project will produce novel sub-genomic data and 3D scans that will be shared in online repositories. I will be aided by my hosts and their world-renowned museum collections to deliver this novel and cutting-edge project which will act as a springboard for my own independent research and teaching program.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

NATURAL HISTORY MUSEUM
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 212 933,76
Adresse
CROMWELL ROAD
SW7 5BD London
Royaume-Uni

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Région
London Inner London — West Kensington & Chelsea and Hammersmith & Fulham
Type d’activité
Public bodies (excluding Research Organisations and Secondary or Higher Education Establishments)
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 212 933,76
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