RNA Bioinformatics by Robustness Analysis of Parameter Space Optimization for Dynamic Programming

Información del proyecto

RNA-RAPSODY

Identificador del acuerdo de subvención: 101029676

DOI

10.3030/101029676

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 24 Marzo 2021

Fecha de inicio 1 Mayo 2021

Fecha de finalización 17 Diciembre 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total

€ 196 707,84

Aportación de la UE

€ 196 707,84

Coordinado por

ECOLE POLYTECHNIQUE
France

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Publicaciones

Peer reviewed articles (4)

City composition and accessibility statistics in and around Paris

Autores: Marie-Olive Thaury, Simon Genet, Léopold Maurice, Paola Tubaro, Sarah J. Berkemer
Publicado en: Frontiers in Big Data, Edición 7, 2024, ISSN 2624-909X
Editor: Frontiers
DOI: 10.3389/fdata.2024.1354007

Toward a Systematic Assessment of Sex Differences in Cystic Fibrosis

Autores: Christiane Gärtner, Jörg Fallmann, Peter F. Stadler, Thorsten Kaiser, Sarah J. Berkemer
Publicado en: Journal of Personalized Medicine, Edición 13, 2023, Página(s) 924, ISSN 2075-4426
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/jpm13060924

Automated design of dynamic programming schemes for RNA folding with pseudoknots

Autores: Bertrand Marchand, Sebastian Will, Sarah J. Berkemer, Yann Ponty, Laurent Bulteau
Publicado en: Algorithms for Molecular Biology, Edición 18, 2023, ISSN 1748-7188
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13015-023-00229-z

Infrared: a declarative tree decomposition-powered framework for bioinformatics

Autores: Hua-Ting Yao, Bertrand Marchand, Sarah J. Berkemer, Yann Ponty, Sebastian Will
Publicado en: Algorithms for Molecular Biology, Edición 19, 2024, ISSN 1748-7188
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13015-024-00258-2

Conference proceedings (1)

RNA Triplet Repeats: Improved Algorithms for Structure Prediction and Interactions

Autores: Kimon Boehmer and Sarah J. Berkemer and Sebastian Will and Yann Ponty
Publicado en: WABI proceedings, 2024
Editor: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik
DOI: 10.4230/lipics.wabi.2024.18