RNA Bioinformatics by Robustness Analysis of Parameter Space Optimization for Dynamic Programming

Projektinformationen

RNA-RAPSODY

ID Finanzhilfevereinbarung: 101029676

DOI

10.3030/101029676

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 24 März 2021

Startdatum 1 Mai 2021

Enddatum 17 Dezember 2024

Finanziert unter

• SOCIETAL CHALLENGES - Europe In A Changing World - Inclusive, Innovative And Reflective Societies

Gesamtkosten

€ 196 707,84

EU-Beitrag

€ 196 707,84

Koordiniert durch

ECOLE POLYTECHNIQUE
France

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (4)

City composition and accessibility statistics in and around Paris

Autoren: Marie-Olive Thaury, Simon Genet, Léopold Maurice, Paola Tubaro, Sarah J. Berkemer
Veröffentlicht in: Frontiers in Big Data, Ausgabe 7, 2024, ISSN 2624-909X
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fdata.2024.1354007

Toward a Systematic Assessment of Sex Differences in Cystic Fibrosis

Autoren: Christiane Gärtner, Jörg Fallmann, Peter F. Stadler, Thorsten Kaiser, Sarah J. Berkemer
Veröffentlicht in: Journal of Personalized Medicine, Ausgabe 13, 2023, Seite(n) 924, ISSN 2075-4426
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/jpm13060924

Automated design of dynamic programming schemes for RNA folding with pseudoknots

Autoren: Bertrand Marchand, Sebastian Will, Sarah J. Berkemer, Yann Ponty, Laurent Bulteau
Veröffentlicht in: Algorithms for Molecular Biology, Ausgabe 18, 2023, ISSN 1748-7188
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13015-023-00229-z

Infrared: a declarative tree decomposition-powered framework for bioinformatics

Autoren: Hua-Ting Yao, Bertrand Marchand, Sarah J. Berkemer, Yann Ponty, Sebastian Will
Veröffentlicht in: Algorithms for Molecular Biology, Ausgabe 19, 2024, ISSN 1748-7188
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13015-024-00258-2

Conference proceedings (1)

RNA Triplet Repeats: Improved Algorithms for Structure Prediction and Interactions

Autoren: Kimon Boehmer and Sarah J. Berkemer and Sebastian Will and Yann Ponty
Veröffentlicht in: WABI proceedings, 2024
Herausgeber: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik
DOI: 10.4230/lipics.wabi.2024.18