RNA Bioinformatics by Robustness Analysis of Parameter Space Optimization for Dynamic Programming

Informations projet

RNA-RAPSODY

N° de convention de subvention: 101029676

DOI

10.3030/101029676

Projet clôturé

Date de signature de la CE 24 Mars 2021

Date de début 1 Mai 2021

Date de fin 17 Decembre 2024

Financé au titre de

• SOCIETAL CHALLENGES - Europe In A Changing World - Inclusive, Innovative And Reflective Societies

Coût total

€ 196 707,84

Contribution de l’UE

€ 196 707,84

Coordonné par

ECOLE POLYTECHNIQUE
France

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (4)

City composition and accessibility statistics in and around Paris

Auteurs: Marie-Olive Thaury, Simon Genet, Léopold Maurice, Paola Tubaro, Sarah J. Berkemer
Publié dans: Frontiers in Big Data, Numéro 7, 2024, ISSN 2624-909X
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fdata.2024.1354007

Toward a Systematic Assessment of Sex Differences in Cystic Fibrosis

Auteurs: Christiane Gärtner, Jörg Fallmann, Peter F. Stadler, Thorsten Kaiser, Sarah J. Berkemer
Publié dans: Journal of Personalized Medicine, Numéro 13, 2023, Page(s) 924, ISSN 2075-4426
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/jpm13060924

Automated design of dynamic programming schemes for RNA folding with pseudoknots

Auteurs: Bertrand Marchand, Sebastian Will, Sarah J. Berkemer, Yann Ponty, Laurent Bulteau
Publié dans: Algorithms for Molecular Biology, Numéro 18, 2023, ISSN 1748-7188
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13015-023-00229-z

Infrared: a declarative tree decomposition-powered framework for bioinformatics

Auteurs: Hua-Ting Yao, Bertrand Marchand, Sarah J. Berkemer, Yann Ponty, Sebastian Will
Publié dans: Algorithms for Molecular Biology, Numéro 19, 2024, ISSN 1748-7188
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13015-024-00258-2

Conference proceedings (1)

RNA Triplet Repeats: Improved Algorithms for Structure Prediction and Interactions

Auteurs: Kimon Boehmer and Sarah J. Berkemer and Sebastian Will and Yann Ponty
Publié dans: WABI proceedings, 2024
Éditeur: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik
DOI: 10.4230/lipics.wabi.2024.18