Description du projet
Aperçu de la complexité de la déficience en GATA2
Le GATA2 est un facteur de transcription qui joue un rôle clé dans le développement hématopoïétique. Les mutations du gène GATA2 affectent les cellules progénitrices hématopoïétiques et peuvent entraîner une insuffisance médullaire et un risque accru de leucémie. Le projet scGATA2track, financé par l’UE, étudie la variabilité du phénotype des familles présentant un déficit en GATA2. L’objectif principal sera de déchiffrer les mécanismes génétiques et épigénétiques au niveau monocellulaire afin de déterminer les acteurs clés de la maladie progressive. Les résultats aideront à la détection précoce de la leucémie et conduiront à la conception de nouvelles stratégies thérapeutiques personnalisées.
Objectif
Precision medicine has improved overall survival of cancer patients; unfortunately, not all diseases can benefit from this practice due to a scarce understanding of their molecular mechanisms. This is the case of GATA2 deficiency, a complex multi-system disorder characterized by bone marrow failure, immunodeficiency and high risk to develop myelodysplastic syndrome (MDS) and acute myeloid leukemia (AML). Chemotherapy and allogenic hematopoietic stem cell (HSC) transplantation are the only available treatments, underlining the lack of predictive tools as a clear medical need.
Penetrance and expressivity within GATA2 families is often variable, suggesting that cooperating somatic mutations and epigenetic events are required to trigger the disease. Here I propose to unravel the molecular mechanisms of malignant progression of GATA2 deficiency by combining single cell multi-OMICs approaches with groundbreaking functional assays in human induced pluripotent stem cells (hiPSCs).
First, to identify pathogenic single nucleotide variations and small insertion-deletions, I will perform an integrative analysis combining whole exome sequencing with whole-genome bisulfite sequencing to analyze the methylation status genome wide on 15 well-annotated GATA2 carriers.
Then, I will model the stepwise progression of normal cells to MDS through the sequential introduction of recurrent GATA2 mutations and known second driver mutations in hiPSCs by CRISPR/Cas9 genome editing. The hiPSC-derived hematopoietic progenitors will be used for simultaneous profiling of transcriptome and chromatin accessibility at single cell resolution to decipher the underlying gene regulatory networks among the different genetic backgrounds.
A thorough understanding of the genetic and epigenetic features of GATA2 carriers and the transcriptional dynamics during cancer initiation/progression will provide valuable insight into early detection and the design of novel personalized therapeutic strategies.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale génie génétique thérapie génique
- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale technologies cellulaires cellule souche
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé médecine personnalisée
- sciences médicales et de la santé médecine clinique transplantation
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie leucémie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
08908 L'Hospitalet De Llobregat
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.