Opis projektu
Badanie złożonej natury niedoboru GATA2
GATA2 to czynnik transkrypcyjny, który odgrywa ważną rolę w rozwoju układu krwiotwórczego. Mutacje genu GATA2 mają wpływ na komórki progenitorowe szlaku hematopoezy oraz mogą prowadzić do zaburzeń czynności szpiku kostnego i zwiększenia ryzyka białaczki. Zespół finansowanego ze środków UE projektu scGATA2track bada zmienność fenotypową rodzin z niedoborem GATA2. Głównym celem prac jest zbadanie mechanizmów genetycznych i epigenetycznych działających na poziomie pojedynczej komórki oraz wskazanie najważniejszych czynników związanych z postępującą chorobą. Uzyskane wyniki pomogą we wczesnym wykrywaniu białaczki i opracowywaniu nowatorskich spersonalizowanych strategii leczenia.
Cel
Precision medicine has improved overall survival of cancer patients; unfortunately, not all diseases can benefit from this practice due to a scarce understanding of their molecular mechanisms. This is the case of GATA2 deficiency, a complex multi-system disorder characterized by bone marrow failure, immunodeficiency and high risk to develop myelodysplastic syndrome (MDS) and acute myeloid leukemia (AML). Chemotherapy and allogenic hematopoietic stem cell (HSC) transplantation are the only available treatments, underlining the lack of predictive tools as a clear medical need.
Penetrance and expressivity within GATA2 families is often variable, suggesting that cooperating somatic mutations and epigenetic events are required to trigger the disease. Here I propose to unravel the molecular mechanisms of malignant progression of GATA2 deficiency by combining single cell multi-OMICs approaches with groundbreaking functional assays in human induced pluripotent stem cells (hiPSCs).
First, to identify pathogenic single nucleotide variations and small insertion-deletions, I will perform an integrative analysis combining whole exome sequencing with whole-genome bisulfite sequencing to analyze the methylation status genome wide on 15 well-annotated GATA2 carriers.
Then, I will model the stepwise progression of normal cells to MDS through the sequential introduction of recurrent GATA2 mutations and known second driver mutations in hiPSCs by CRISPR/Cas9 genome editing. The hiPSC-derived hematopoietic progenitors will be used for simultaneous profiling of transcriptome and chromatin accessibility at single cell resolution to decipher the underlying gene regulatory networks among the different genetic backgrounds.
A thorough understanding of the genetic and epigenetic features of GATA2 carriers and the transcriptional dynamics during cancer initiation/progression will provide valuable insight into early detection and the design of novel personalized therapeutic strategies.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu biotechnologia medyczna inżynieria genetyczna terapia genowa
- medycyna i nauki o zdrowiu biotechnologia medyczna technologie komórkowe komórki macierzyste
- medycyna i nauki o zdrowiu nauki o zdrowiu medycyna spersonalizowana
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna transplantacja
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia białaczka
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
08908 L'Hospitalet De Llobregat
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.