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Regulation of Processing Body Composition, Function and Fate during Different Stresses at Endoplasmic Reticulum-Membrane Contact Sites

Descripción del proyecto

Regulación de la composición, dinámica y renovación de los cuerpos de procesamiento en condiciones de estrés

El estrés de las células eucariotas provoca la formación de gránulos de estrés citoplasmáticos y cuerpos de procesamiento (PB, por sus siglas en inglés). La dinámica de ensamblaje y desensamblaje de los gránulos de PB sin membranas, así como su composición, varía en función del tipo de estrés. El equipo del proyecto PBStressERMCSs, financiado por las Acciones Marie Skłodowska-Curie, propone estudiar el contenido, la dinámica y renovación de los PB en condiciones de estrés mitocondrial/lisosómico y del retículo endoplasmático, inducido con métodos farmacológicos y genéticos intensivos. En el estudio se utilizarán PB purificados y llevará a cabo análisis con espectrometría de masas-cromatografía de líquidos, así como secuenciación del ARN para el contenido de ARN, con el fin de identificar las señales que afectan a la ubicación, el desarrollo y la conservación de la respuesta al estrés de los PB en células de mamíferos.

Objetivo

One of the first responses to eukaryotic cellular stress is the formation of cytoplasmic granules like processing bodies (PBs) and stress granules (SGs). PBs are membrane-less structures that are dynamic in their assembly/disassembly and composition depending on the type of stress that they encounter. While glucose starvation is the main stress applied to study PB formation and dynamics, much less is known about PBs under other stresses, especially endoplasmic reticulum (ER) and mitochondrial/lysosomal stresses. We propose to study the formation, content and dynamics of PBs under ER and mitochondrial/lysosomal stresses, together with their turnover (autophagy/dissolution) during stress recovery. I plan to use pharmacological and acute genetic interventions to induce stresses. PBs will be purified according to the established protocol in the laboratory, which enables subsequent Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) analysis for proteins and RNA-sequencing for the RNA content. Probing stress response further, we will also perform total RNA-sequencing and Ribosome-profiling. The fate of specific sets of mRNAs will be determined by FISH-IF and RNA decay analysis, thereby identifying the signals effectuating PB localization and fate (storage or decay) during ER and mitochondrial/lysosomal stress. The study will be extended to check conservation of PB stress response in mammalian cells. The proposed research will provide a holistic view on the pathways that are up- or down-regulated during ER and mitochondrial/lysosomal stress, the identification of common pathways between the different stresses and PB -mRNA and protein- turnover. This project will be of high impact in the fields of cancer, cell, and neuro biology.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2020

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

UNIVERSITAT BASEL
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 191 149,44
Dirección
PETERSPLATZ 1
4051 Basel
Suiza

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Región
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 191 149,44
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