Description du projet
Régulation de la composition, de la dynamique et du renouvellement des organismes de traitement dans des conditions de stress
Le stress cellulaire des eucaryotes entraîne la formation de granules de stress cytoplasmique et d’organismes de traitement (PB pour «processing bodies»). Les granules et PB sans membrane varient dans leur dynamique d’assemblage ou désassemblage et leur composition en fonction du type de stress. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet PBStressERMCSs propose d’étudier le contenu, la dynamique et le renouvellement des PB dans des conditions de stress à l’échelle des lysosomes, des mitochondries et du réticulum endoplasmique, induit par des interventions pharmacologiques et génétiques aiguës. L’étude emploiera des PB purifiés et l’analyse par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse pour le séquençage de l’ARN et des protéines afin que le contenu de l’ARN permette d’identifier les signaux affectant la localisation, le développement et la conservation de la réponse au stress des PB dans des cellules de mammifères.
Objectif
One of the first responses to eukaryotic cellular stress is the formation of cytoplasmic granules like processing bodies (PBs) and stress granules (SGs). PBs are membrane-less structures that are dynamic in their assembly/disassembly and composition depending on the type of stress that they encounter. While glucose starvation is the main stress applied to study PB formation and dynamics, much less is known about PBs under other stresses, especially endoplasmic reticulum (ER) and mitochondrial/lysosomal stresses. We propose to study the formation, content and dynamics of PBs under ER and mitochondrial/lysosomal stresses, together with their turnover (autophagy/dissolution) during stress recovery. I plan to use pharmacological and acute genetic interventions to induce stresses. PBs will be purified according to the established protocol in the laboratory, which enables subsequent Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) analysis for proteins and RNA-sequencing for the RNA content. Probing stress response further, we will also perform total RNA-sequencing and Ribosome-profiling. The fate of specific sets of mRNAs will be determined by FISH-IF and RNA decay analysis, thereby identifying the signals effectuating PB localization and fate (storage or decay) during ER and mitochondrial/lysosomal stress. The study will be extended to check conservation of PB stress response in mammalian cells. The proposed research will provide a holistic view on the pathways that are up- or down-regulated during ER and mitochondrial/lysosomal stress, the identification of common pathways between the different stresses and PB -mRNA and protein- turnover. This project will be of high impact in the fields of cancer, cell, and neuro biology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Mots‑clés
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
4051 Basel
Suisse