Descripción del proyecto
Un enfoque integrado de la maduración alternativa de la titina en la miocardiopatía dilatada familiar
Las mutaciones en la proteína sarcomérica titina (TTN) están asociadas con la miocardiopatía dilatada (MCD) familiar, y la maduración alternativa de la TTN está vinculada causalmente con la DCM. La maduración alternativa de la TTN está regulada por el gen de proteínas RBM20, cuyas mutaciones están asociadas a una MCD agresiva. El proyecto financiado con fondos europeos TITINmap se propone elucidar la maduración alternativa de la titina mediada por RBM20 desarrollando un medio para detectar todas las isoformas de transcripción producidas por los 364 exones de la TTN. La combinación de este método con ensayos complementarios basados en células madre permitirá analizar el repertorio de isoformas de TTN relacionadas con las mutaciones de RBM20 relacionadas con enfermedades. El objetivo final del proyecto es producir un mapa integral de la maduración de la TTN integrando los datos de sus isoformas y proteínas reguladoras.
Objetivo
The sarcomeric protein titin (TTN) is mutated in 30% of patients with familial dilated cardiomyopathy (DCM), a common heart disease that is a global threat to the aging society. Aberrant alternative splicing of TTN is causally linked to DCM, therefore, to understand mechanisms of TTN splicing is crucial for developing therapeutic options, which so far do not exist for DCM. RBM20, a protein that regulates alternative splicing of TTN, is also mutated in many patients with an aggressive form of DCM. How RBM20 mediates alternative splicing of TTN is largely unknown. Due to its gigantic size, TTN mRNA is often precluded from transcriptome-wide single-cell analysis. Here, I aim to understand alternative splicing of TTN mediated by RBM20 on a single-cell level. To this end, I propose to develop a method for the detection of all transcript isoforms that can be produced by the 364 exons of TTN. Using this tool, termed TITIN-seq, together with complementary stem cell-based assays, I seek to analyze changes in the repertoire of TTN isoforms upon disease-relevant mutations in the RBM20 gene. Moreover, TITIN-seq is used to identify novel splice regulators of TTN, which, together with RBM20, could complete the picture of alternative splicing of TTN. The overarching goal is to construct a comprehensive map of TTN splicing by integrating data of all its isoforms in single cells and its regulatory proteins. I envision that knowledge of such a splice map can be exploited for developing therapeutic strategies to revert aberrant splicing of TTN in patients with DCM.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
69117 Heidelberg
Alemania