Projektbeschreibung
Ein integrierter Ansatz zum alternativen Spleißen von Titin bei familiärer dilatativer Kardiomyopathie
Mutationen im Sarkomer-Protein Titin (TTN) werden mit familiärer dilatativer Kardiomyopathie in Verbindung gebracht, und das alternative Spleißen von TTN steht in kausalem Zusammenhang mit dilatativer Kardiomyopathie. Das alternative Spleißen von TTN wird durch das RBM20-Protein reguliert, dessen Mutationen mit aggressiver dilatativer Kardiomyopathie in Verbindung gebracht wird. Das EU-finanzierte Projekt TITINmap zielt darauf ab, das RBM20-vermittelte alternative Spleißen von TTN aufzuklären, indem ein Verfahren zum Nachweis aller Transkript-Isoformen entwickelt wird, die von den 364 Exons von TTN produziert werden. Die Verbindung dieses Ansatzes mit ergänzenden stammzellbasierten Testverfahren wird die Analyse des Repertoires der TTN-Isoformen ermöglichen, die mit krankheitsrelevanten Mutationen in RBM20 in Verbindung stehen. Das übergeordnete Ziel des Projekts ist es, eine umfassende Karte des TTN-Spleißens zu erstellen, indem die Daten seiner Isoformen und regulatorischen Proteine integriert werden.
Ziel
The sarcomeric protein titin (TTN) is mutated in 30% of patients with familial dilated cardiomyopathy (DCM), a common heart disease that is a global threat to the aging society. Aberrant alternative splicing of TTN is causally linked to DCM, therefore, to understand mechanisms of TTN splicing is crucial for developing therapeutic options, which so far do not exist for DCM. RBM20, a protein that regulates alternative splicing of TTN, is also mutated in many patients with an aggressive form of DCM. How RBM20 mediates alternative splicing of TTN is largely unknown. Due to its gigantic size, TTN mRNA is often precluded from transcriptome-wide single-cell analysis. Here, I aim to understand alternative splicing of TTN mediated by RBM20 on a single-cell level. To this end, I propose to develop a method for the detection of all transcript isoforms that can be produced by the 364 exons of TTN. Using this tool, termed TITIN-seq, together with complementary stem cell-based assays, I seek to analyze changes in the repertoire of TTN isoforms upon disease-relevant mutations in the RBM20 gene. Moreover, TITIN-seq is used to identify novel splice regulators of TTN, which, together with RBM20, could complete the picture of alternative splicing of TTN. The overarching goal is to construct a comprehensive map of TTN splicing by integrating data of all its isoforms in single cells and its regulatory proteins. I envision that knowledge of such a splice map can be exploited for developing therapeutic strategies to revert aberrant splicing of TTN in patients with DCM.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Mutation
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2020
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
69117 Heidelberg
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.