Obiettivo
Our intestinal tract offers an attractive environment for bacteria. The beneficial bacteria of our microbiota feast on undigested foods and provide numerous health benefits. Enteric pathogens see this environment as an entry point for infection. Both groups influence each other, creating a tripartite interaction with us, the host. Understanding this interaction represents an emerging research area to combat infections poised to improve human health.
Bacteroides are key commensals in these triangular interactions, as they produce diffusible intermediates as part of their metabolism that are utilized by pathogens and the host. These metabolites arise from the action of ~100 polysaccharide utilization loci (PUL) that have been a major focus, from biochemistry to gene regulation. While the field has focused mostly on transcriptional PUL control, recent work from my group and others demonstrated that Bacteroides employ noncoding RNAs to regulate metabolic genes. These insights raise the questions: what is the mechanism by which noncoding RNAs regulate PUL, and how do these mechanisms fit within the tripartite interaction between Bacteroides, the host, and pathogens?
In GUT-CHECK, I hypothesize that PUL regulation integrates transcriptional and RNA-mediated post-transcriptional control, which in turn shape the outcome of host-pathogen interactions. To test this hypothesis, I will answer three specific questions:
1) How is PUL expression regulated?
2) How does PUL regulation impact interactions with pathogens and the host?
3) To what extent can PUL regulation be manipulated to thwart pathogen invasion?
The proposed work will incorporate a three-way model for Bacteroides, host tissue, and a pathogen along with modern techniques such as CRISPR-based screens and Triple RNA-seq. The functional insights gained will establish fundamental understanding of host-microbiota-pathogen interaction and may lead to novel RNA-based treatments for intestinal infections.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
La classificazione di questo progetto è stata convalidata dal team del progetto.
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La classificazione di questo progetto è stata convalidata dal team del progetto.
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2021-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
97070 Wuerzburg
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.