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Dissecting the role of sperm transcriptome dynamics in intergenerational inheritance through native RNA nanopore sequencing

Descrizione del progetto

Regolazione dell’RNA spermatico basata sulla dieta

Prove emergenti sottolineano l’importanza di fattori ambientali quali stress, dieta e tossine sull’epigenetica dello sperma dei mammiferi. Si ritiene che l’RNA trasporti tali informazioni epigenetiche attraverso le generazioni e regoli la salute metabolica della discendenza. Finanziato dal Consiglio europeo della ricerca, il progetto EpiSperm si propone di delineare le modificazioni dell’RNA che influenzano la dinamica trascrittomica ed epigenetica dell’RNA nello sperma utilizzando una nuova tecnologia di sequenziamento. I ricercatori otterranno una visione olistica delle dinamiche dell’RNA a livello di singola cellula. Inoltre, sveleranno candidati in grado di trasmettere fenotipi paterni indotti dalla dieta alla generazione successiva.

Obiettivo

Mammalian sperm RNA is increasingly recognized as an additional source of paternal hereditary information beyond DNA. Environmental inputs, such as diet and stress, can reshape the sperm RNA signature and induce offspring phenotypes that relate to paternal environmental stressors. However, how, when and to what extent sperm RNA populations change, and what is the role that RNA modifications and other post-transcriptional regulatory layers play in shaping sperm RNA dynamics, remains poorly understood. Here, we propose to characterize the dynamics of RNA populations during sperm formation and maturation using native RNA nanopore sequencing. This technology is suited to provide an integrative and comprehensive view of the transcriptome, epitranscriptome, degradation patterns and tailing dynamics simultaneously, and with single molecule resolution. We will establish novel library preparation methods that can capture the full sperm (epi)transcriptome, and will capitalize on our recently developed algorithms to map and quantify RNA modifications in individual RNA molecules. We will then apply these methods to reveal how paternal dietary exposures affect sperm RNA populations and the metabolic phenotypes of their offspring, and test whether the novel identified RNA candidates can transmit diet-induced paternal phenotypes to the subsequent generation. Finally, we propose to expand our previous work on direct RNA multiplexing to establish single cell direct RNA nanopore sequencing, to characterize the diversity and heterogeneity of the sperm RNA (epi)transcriptome at an unprecedented single cell and single molecule resolution.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2021-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 499 428,00
Indirizzo
CARRER DOCTOR AIGUADER 88
08003 Barcelona
Spagna

Mostra sulla mappa

Regione
Este Cataluña Barcelona
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 499 428,00

Beneficiari (1)

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