dAta-dRiven integrated approaches to CHemIcal safety assessMEnt and Drug dEvelopment

Projektinformationen

ARCHIMEDES

ID Finanzhilfevereinbarung: 101043848

DOI

10.3030/101043848

EK-Unterschriftsdatum 3 Juni 2022

Startdatum 1 September 2022

Enddatum 31 August 2027

Finanziert unter

• European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 000 000,00

EU-Beitrag

€ 2 000 000,00

Koordiniert durch

TAMPEREEN KORKEAKOULUSAATIO SR
Finland

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Leistungen

Documents, reports (1)

Data Management Plan

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (11)

A Network Toxicology Approach for Mechanistic Modelling of Nanomaterial Hazard and Adverse Outcomes

Autoren: Giusy del Giudice; Angela Serra; Alisa Pavel; Marcella Torres Maia; Laura Aliisa Saarimäki; Michele Fratello; Antonio Federico; Harri Alenius; Bengt Fadeel; Dario Greco
Veröffentlicht in: Advanced Science, Vol 11, Iss 32, Pp n/a-n/a (2024), 2024, ISSN 2198-3844
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1101/2024.01.06.574295

Human Genomics

Autoren: Antonio Federico; Alisa Pavel; Lena Möbus; David McKean; Giusy del Giudice; Vittorio Fortino; Hanna Niehues; Joe Rastrick; Kilian Eyerich; Stefanie Eyerich; Ellen van den Bogaard; Catherine Smith; Stephan Weidinger; Emanuele de Rinaldis; Dario Greco
Veröffentlicht in: Human Genomics, 2021, ISSN 1473-9542
Herausgeber: BMC
DOI: 10.1101/2021.05.10.443441

The potential of a data centred approach & knowledge graph data representation in chemical safety and drug design

Autoren: Pavel, Alisa; Saarimäki, Laura A; Möbus, Lena; Federico, Antonio; Serra, Angela; Greco, Dario
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, 2022, ISSN 2001-0370
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2022.08.061

Toxicogenomics Data for Chemical Safety Assessment and Development of New Approach Methodologies: An Adverse Outcome Pathway‐Based Approach

Autoren: Saarimäki, Laura Aliisa; Morikka, Jack; Pavel, Alisa; Korpilähde, Seela; del Giudice, Giusy; Federico, Antonio; Fratello, Michele; Serra, Angela; Greco, Dario
Veröffentlicht in: Advanced Science, 2022, ISSN 2198-3844
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/advs.202203984

A Multi‐Dimensional Approach to Map Disease Relationships Challenges Classical Disease Views

Autoren: Lena Möbus; Angela Serra; Michele Fratello; Alisa Pavel; Antonio Federico; Dario Greco
Veröffentlicht in: Advanced Science, Vol 11, Iss 30, Pp n/a-n/a (2024), 2024, ISSN 2198-3844
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/advs.202401754

Journal of Translational Medicine

Autoren: Antonio Federico; Lena Möbus; Zeyad Al-Abdulraheem; Alisa Pavel; Vittorio Fortino; Giusy del Giudice; Harri Alenius; Nanna Fyhrquist; Dario Greco
Veröffentlicht in: Journal of Translational Medicine, Vol 22, Iss 1, Pp 1-13 (2024), 2023, ISSN 1479-5876
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12967-024-04879-4

KNeMAP: a network mapping approach for knowledge-driven comparison of transcriptomic profiles

Autoren: Alisa Pavel; Giusy del Giudice; Michele Fratello; Leo Ghemtio; Antonio Di Lieto; Jari Yli-Kauhaluoma; Henri Xhaard; Antonio Federico; Angela Serra; Dario Greco
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2023, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btad341

A curated gene and biological system annotation of adverse outcome pathways related to human health

Autoren: Laura Aliisa Saarimäki; Michele Fratello; Alisa Pavel; Seela Korpilähde; Jenni Leppänen; Angela Serra; Dario Greco
Veröffentlicht in: Scientific Data, 2023, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1038/s41597-023-02321-w

The in vitro immunomodulatory effect of multi-walled carbon nanotubes by multilayer analysis

Autoren: Hautanen, Veera; Morikka, Jack; Saarimäki, Laura Aliisa; Bisenberger, Jan; Toimela, Tarja; Serra, Angela; Greco, Dario
Veröffentlicht in: NanoImpact, 2023, ISSN 2452-0748
Herausgeber: Science direct
DOI: 10.1016/j.impact.2023.100476

Expanding adverse outcome pathways towards one health models for nanosafety

Autoren: Laura Aliisa Saarimäki; Laura Aliisa Saarimäki; Giusy del Giudice; Giusy del Giudice; Dario Greco; Dario Greco; Dario Greco
Veröffentlicht in: Frontiers in Toxicology, Vol 5 (2023), 2023, ISSN 2673-3080
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/ftox.2023.1176745

Nature Nanotechnology

Autoren: del Giudice G, Serra A, Saarimäki LA, Kotsis K, Rouse I, Colibaba SA, Jagiello K, Mikolajczyk A, Fratello M, Papadiamantis AG, Sanabria N, Annala ME, Morikka J, Kinaret PAS, Voyiatzis E, Melagraki G, Afantitis A, Tämm K, Puzyn T, Gulumian M, Lobaskin V,
Veröffentlicht in: Nature Nanotechnology, Ausgabe 18, 957–966 (2023), 2023, ISSN 1748-3387
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S41565-023-01393-4

Thesis and dissertations (1)

Knowledge Graphs, Network Models and Health Data Science Approaches for Toxicology and Pharmacology

Autoren: Pavel, Alisa
Veröffentlicht in: 2024
Herausgeber: Tampere University