Projektbeschreibung
In-vivo-Genomeditierung des Darmmikrobioms unterstützt gezielte Therapien
Die Entdeckung der „Genschere“ CRISPR-Cas9 öffnete vor einigen Jahrzehnten die Tür zu Therapeutika jenseits aller Vorstellungen. Dieses System zur Genomeditierung bietet ein spannendes Potenzial für die In-vivo-Behandlung vieler Krankheiten und Leiden. Das EU-finanzierte Projekt crInSitu wird die Grundlagen für solche Behandlungen durch Manipulationen des menschlichen Darmbioms schaffen, dessen Rolle für die allgemeine Gesundheit und das Wohlbefinden zunehmend anerkannt wird. Das Team wird Bakterien finden, die sich für die Editierung eignen, Phagenvektoren entwickeln, um maßgeschneiderte genetische Schaltkreise in das Mikrobiom einzubringen, und mit CRISPR-Werkzeugen genetische Störungen in der Darmumgebung vornehmen. Die Verabreichung an den Darm von Mäusen wird die Entwicklung zukünftiger, auf das Mikrobiom ausgerichteter Therapien unterstützen.
Ziel
Humans live in a symbiotic relationship with trillions of microorganisms that inhabit our bodies and play an important role in health and disease. There is a growing interest in manipulating the microbiome to improve health, yet we currently lack the knowledge and technology to carry out precise interventions. The objective of this proposal is to enable efficient in situ genetic perturbations of bacteria in the gut environment by developing the next generation of synthetic biology tools based on bacteriophage delivery vectors and CRISPR-Cas systems. The first aim is to establish a collection of genetically amenable bacteria of the human gut and the associated vectors. This will be achieved by delivering large combinatorial libraries of vectors to complex bacterial communities followed by the high-throughput identification and isolation of successfully modified bacteria. We will also identify bacterial defense systems against horizontal gene transfer and methods to bypass them. The second aim is to engineer and evolve phage vectors to deliver custom genetic circuits to the microbiome, using two main approaches: the construction of chimeric phage capsids, and the in vivo targeted mutagenesis of phage host range determinants using diversity generating retro-elements. The third aim is to perform in situ genetic perturbations in the gut environment using CRISPR-Cas tools. We will evaluate the efficiency and specificity of our phage vectors in the animal gut environment. Finally we will use our phage vectors to deliver CRISPR-Cas systems to bacteria in the mouse gut and perform forward genetic screens. This will shed light on the genetic requirements for growth in the gut and on the niche occupied by different members of the microbiome. Altogether, the knowledge and technologies developed in this project will be instrumental both to further our understanding of the gut microbiome and for the development of future microbiome targeted therapies.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
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Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2021-COG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
75724 Paris
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.