Projektbeschreibung
Die Funktion epigenetischer Modifikatoren bei der Festlegung des Zellschicksals
Unser Verständnis der Transkriptionsdynamik, die der Zelllinienspezifikation zugrunde liegt, hat sich dank der Einzelzell-RNS-Sequenzierung erheblich verbessert. Obwohl epigenetische Modifikatoren eine wichtige Funktion übernehmen, ist es nur wenig erforscht, wie sie diesen hochdynamischen Prozess lenken. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen wird das Projekt EpiDevoTimeMachine Licht in die Geheimnisse der epigenetischen Modifikatoren in Bezug auf die Festlegung des Zellschicksals bringen. Hier sind wichtige Auswirkungen auf unser Verständnis der Regulation der Säugetierentwicklung zu erwarten. Im Einzelnen wird das Projekt die kombinierte Dynamik und Wechselwirkungen der Transkription und der Polycomb-Gruppe von Proteinen während der Differenzierung von embryonalen Stammzellen der Maus zu Gastruloiden untersuchen.
Ziel
During development, a cell's fate will become increasingly restricted, facilitated by the combined activity of transcription factors and epigenetic modifiers. Single-cell RNA sequencing has greatly improved our appreciation of the transcriptional dynamics underlying lineage specification. However, we still do not fully comprehend how epigenetic modifiers guide this highly dynamic process, as methods that enable us to accurately concatenate a cell's past and present epigenetic state with its current lineage identity are missing.
Here, I propose to investigate the combined dynamics and interdependencies of transcription and the polycomb-group of proteins during the differentiation of mouse embryonic stem cells into gastruloids. First, I aim to deploy a protocol that enables the simultaneous quantification of both layers in the same single cell to disentangle epigenetic from transcriptional heterogeneity. Second, I aim to develop a molecular memory system to record the past epigenetic profiles of single cells. This system will be based on the expression of proteins fused to a bacterial Dcm methylase, which will allow for the timed recording and faithful transmission of historic epigenetic profiles. Combined with quantification of transcription of the same single cell, this will enable us to directly integrate past epigenetic states with the current identity of single cells.
The proposed work here will therefore allow us to directly assess the role of epigenetic modifiers on establishing cell fate choice and will have important implications on our understanding of the regulation of mammalian development.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Epigenetik
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2021-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1011 JV AMSTERDAM
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.