Opis projektu
Znaczenie modyfikatorów epigenetycznych w wyborze losu komórek
Obecnie dysponujemy znacznie większą wiedzą na temat dynamiki transkrypcji leżącej u podstaw specyfikacji linii rozwojowych dzięki sekwencjonowaniu RNA z pojedynczych komórek. Choć wiemy, że modyfikatory epigenetyczne odgrywają ważną rolę, wciąż nie wiemy dokładnie w jaki sposób wpływają na ten niezwykle dynamiczny proces. Dzięki wsparciu działania „Maria Skłodowska-Curie” projekt EpiDevoTimeMachine rzuci nowe światło na rolę modyfikatorów epigenetycznych w wyborze losu komórki, co będzie miało ważny wpływ na nasze poznanie procesu rozwoju ssaków. W szczególności badacze przyjrzą się połączonej dynamice i wzajemnym zależnościom w procesie transkrypcji oraz białkom z grupy polycomb w procesie różnicowania komórek macierzystych embrionów myszy w gastruloidy.
Cel
During development, a cell's fate will become increasingly restricted, facilitated by the combined activity of transcription factors and epigenetic modifiers. Single-cell RNA sequencing has greatly improved our appreciation of the transcriptional dynamics underlying lineage specification. However, we still do not fully comprehend how epigenetic modifiers guide this highly dynamic process, as methods that enable us to accurately concatenate a cell's past and present epigenetic state with its current lineage identity are missing.
Here, I propose to investigate the combined dynamics and interdependencies of transcription and the polycomb-group of proteins during the differentiation of mouse embryonic stem cells into gastruloids. First, I aim to deploy a protocol that enables the simultaneous quantification of both layers in the same single cell to disentangle epigenetic from transcriptional heterogeneity. Second, I aim to develop a molecular memory system to record the past epigenetic profiles of single cells. This system will be based on the expression of proteins fused to a bacterial Dcm methylase, which will allow for the timed recording and faithful transmission of historic epigenetic profiles. Combined with quantification of transcription of the same single cell, this will enable us to directly integrate past epigenetic states with the current identity of single cells.
The proposed work here will therefore allow us to directly assess the role of epigenetic modifiers on establishing cell fate choice and will have important implications on our understanding of the regulation of mammalian development.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordynator
1011 JV AMSTERDAM
Niderlandy