Ziel
Genome editing has triggered a revolution with stark implications in life science. Recently, a new gene-editing technique CRISPR-Cas has become dominant in laboratory conditions. The first step in a targeted genome modification requires the CRISPR-Cas nuclease to generate a specific DNA double-strand break (DSB). Eukaryotic cells repair the DSBs by the fast but potentially mutagenic Non-Homologous End Joining (NHEJ), and by the accurate Homology Directed Repair (HDR) pathways. Gene editing techniques exploit the HDR to modify the DNA to the desired sequence.
Usually, it is the NHEJ that repairs the DSBs. That presents a threat of introducing mutations and limits gene editing efficiency and use in medical applications. Moreover, even after entering the HDR pathway, an unclear mechanism involving protein 53BP1 and Shieldin complex blocks the pathway from progressing. My goal is to decipher the 53BP1-Shieldin induced block and then assess Shieldin pathway as a possible therapeutic target to increase the frequency of HDR after CRISPR-Cas cleavage.
The objectives include:
1. Reconstitution of the Shieldin pathway in mammalian HEK293 and insect Hi5 cells
2. Structural characterization of the protein assembly at DSBs by electron microscopy and mass spectrometry
3. Biochemical analysis of the relation between DSB repair and Shieldin pathway
In general, the findings can be applied to enhance any gene-editing technique involving a generation of DSBs. Importantly, the results will provide a base for a long-awaited revolution in personalized medicine. The host laboratory of Prof. Montoya already focuses on improving the properties of the Cas nucleases by means of structural biology and the Shieldin project fits right in their research portfolio. Developing the project will boost my career as new skills in structural biology, including protein electron microscopy, will complement my previous expertise in protein-protein interaction and crosslinking mass spectrometry studies.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2021-PF-01
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1165 KOBENHAVN
Dänemark
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