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Unravelling the Silicification prOcess in RHIzaria through GENetics and Skeletal growth

Descrizione del progetto

I Rhizaria, cruciali nel ciclo del silicio nei nostri oceani

Il silicio (Si) rappresenta un importante nutriente negli oceani ed è richiesto da microalghe (diatomee), spugne e Rhizaria. Nel Cambriano, le spugne e i primi protisti, i Rhizaria, dominavano gli oceani e, pertanto, la produzione di silicio in questi mari vasti. Negli oceani odierni, si ritiene che le diatomee dominino il ciclo del silicio, ma un lavoro del progetto Si-ORHIGENS, finanziato dall’UE, ha svelato l’importanza inattesa dei Rhizaria. I ricercatori di Si-ORHIGENS hanno studiato i dati trascrittomici, la deposizione del silicio e i geni responsabili dei processi di silicizzazione nei Rhizaria. Questa ricerca costituirà la base di un approccio più unificato agli studi relativi al plancton e aumenterà la comprensione del trasporto di silicio e dei suoi cicli biogeochimici negli oceani.

Obiettivo

Silicon (Si) is a major nutrient in the global ocean, required for growth by a variety of distantly related organisms, including microalgae, sponges and rhizarians. Silicifying Rhizaria were among the first protists to inhabit the ocean and, together with sponges, dominated the biogenic silica production during the Cambrian era. These organisms became an important, though poorly understood, component of marine ecosystems. In the contemporary ocean, diatoms are thought to dominate the planktonic realm and to be the main contributor to the Si cycle. However, my recent work has revealed that Rhizaria have unexpectedly high individual Si production rates and biogenic silica content, suggesting that their contribution to marine Si and carbon cycles may have been underestimated. This project aims to elucidate the process of silicification in Rhizaria and determine sources of variability in silicic acid uptake of these protists, through three tailored work packages (WPs). The first WP, consists of the analyse of transcriptomic data at a global scale as well as individual transcriptomes of isolated Rhizaria to assess the diversity of Si transporters. Thereafter, the examination of silica deposition, using a fluorescence compound, in a broad range of Rhizaria and varying ambient silicic acid concentrations. The final WP, will be the quantification of gene expression during silicification processes using primers designed within WP1. This highly interdisciplinary project combines bioinformatics, molecular biology and physiology, leading to a more unified approach to plankton research. The outcomes of this project will improve our general understanding of Si transport in Rhizaria as well as our understanding of the biogeochemical cycling of Si in the ocean. This work will also constitute a major advance in my career, as I acquire skills in new research methods beyond my current capacity, and build a unique skillset that will set me ahead of the current rhizarian research scope.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-GF -

Coordinatore

SORBONNE UNIVERSITE
Contributo netto dell'UE
€ 300 441,60
Indirizzo
21 RUE DE L'ECOLE DE MEDECINE
75006 Paris
Francia

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Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Istituti di istruzione secondaria o superiore
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato

Partner (1)