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Molecular Drivers of the InteractionS between marine algicidal KORdia and DIAtoms: from coexistence to algal lysis.

Projektbeschreibung

Die Dynamik zwischen Bakterien und Phytoplankton

Das marine Phytoplankton, wie zum Beispiel Kieselalgen, spielt eine Schlüsselrolle in den biogeochemischen Kreisläufen, da es einen großen Teil der Photosynthese auf der Erde durchführt. Daher ist ihre komplexe und dynamische Interaktion mit Bakterien von größter Bedeutung, da sie symbiotisch oder antagonistisch sein und die Funktion des Phytoplanktons beeinflussen kann. Das im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen realisierte Projekt DISKORDIA konzentriert sich auf die Mechanismen, durch die algizide Bakterien die Lyse in Algen auslösen, sowie auf die Resistenzprozesse des Phytoplanktons. Die Forschenden wollen Gene und Metaboliten untersuchen, die an der Lyse von Phytoplankton durch Bakterien beteiligt sind. Die Ergebnisse von DISKORDIA werden unser Verständnis der Wechselwirkungen verbessern, die in der Meeresumwelt stattfinden und für das marine Nahrungsnetz von zentraler Bedeutung sind.

Ziel

Interactions between marine bacteria and phytoplankton are increasingly recognized as a fundamental shaping force of microbial taxonomic and functional diversity and activity. Algicidal bacteria, found in several marine taxa, possess the ability to induce cellular lysis in marine phytoplankton. Research on cultured strains shows a variety of algicidal properties on distinct phytoplankton host spectra among different bacterial taxa. These observations hint to the existence of an array of diverse but poorly characterized mechanisms implicated at various stages of bacterial-phytoplankton warfare: partner recognition, triggers of lytic activity, bacterial algicidal apparatus, and phytoplankton resistance tools. The research proposed in the DISKORDIA project – named after the Roman goddess of Strife Discordia – aims to provide a deeper understanding of the molecular aspects of the interactions between the algicidal marine bacterial genus Kordia and diatoms, a diverse and ecologically important phytoplankton group. Cutting edge techniques such as transcriptomics and untargeted metabolomics will be combined to enable naive discovery of genes and metabolites potentially involved in bacterial induction and effectors of algicidal activity, and in diatom sensitivity or resistance. In addition, genetic tools will be applied to a model Kordia strain to produce the first genetic system for algicidal bacteria in the Bacteroidetes phylum and test the role of specific bacterial genes in algal lysis. Finally, the ecological relevance of the processes identified by these methods will be explored at a global scale by bioinformatic screening of existing metagenomic and metatranscriptomic datasets from diverse marine environments. Together, these approaches will improve our understanding of the molecular strategies implicated in bacterial algicidal activity and phytoplankton response, while providing tools and a conceptual framework for future studies of microbial interactions.

Koordinator

SORBONNE UNIVERSITE
Netto-EU-Beitrag
€ 155 099,28
Adresse
21 RUE DE L'ECOLE DE MEDECINE
75006 Paris
Frankreich

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Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
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