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Revealing genes that mediate the CIN-induced interferon-inflammatory response using a Genome-wide CRISPR screen coupled to a Suicide Gene Switch.

Description du projet

Instabilité chromosomique et immunité contre le cancer

Les cellules cancéreuses présentent souvent une instabilité chromosomique (CIN) associée à l’accumulation de pertes, de gains et de réarrangements de l’ADN. Une autre caractéristique du cancer est l’évasion immunitaire. Pour concevoir des thérapies anticancéreuses efficaces, il est essentiel de comprendre le lien entre les deux et la manière dont la CIN peut affecter l’évasion immunitaire de la tumeur. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet CRISPRCINIMM étudiera les gènes responsables de l’altération des réponses immunitaires contre les cellules cancéreuses. Les chercheurs feront appel à des technologies d’édition de gènes et de séquençage de nouvelle génération pour identifier les gènes de la voie interféron-inflammatoire qui favorisent l’évolution du cancer et entravent l’immunité anticancéreuse.

Objectif

Chromosomal instability (CIN) and the resulting aneuploidies can fuel the dramatic karyotype changes characteristic of tumorigenesis, helping tumors to alter the expression of immune checkpoints and evolving phenotypes related to immune evasion or stimulation. Anti-tumor immunity appears to be dependent on the type and origin of the tumor, while immune evasion has become an obstacle to designing effective anticancer therapeutics. Understanding when CIN promotes or suppress anti-tumor immunity is therefore needed.

However, the mechanism and initiators by which this adjustment occurs and the role that aneuploidy, CIN or specific karyotypes have in this transition are still in the dark.

In order to understand how CIN drives tumor evolution, we need to know how CIN guide cells into different immunogenic responses. Identifying the genes that adjust the role of CIN and aneuploidy in immune evasion can therefore help us unravel the origins of malignant growth and in the future develop more appropriate therapeutic approaches.

My project plan is set to find the genes that trigger and connect chromosome missegregation to the interferon-inflammatory response in cells suffering from CIN using an unbiased genome-wide CRISPR KO screen coupled to a suicide gene switch in human fibroblasts. The use of a suicide gene switch, normally used for cell-based therapy, allows separation of cells that have lost the inflammatory pathway while the screen, along with a next generation sequencing, will find the genes related to that loss. This screen will serve as a base to understand what underlies cancer immune evasion in chromosomally unstable cells.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Coordinateur

ACADEMISCH ZIEKENHUIS GRONINGEN
Contribution nette de l'UE
€ 187 624,32