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The PomXYZ cluster in the bacterium Myxococcus xanthus: Self-assembly, translocation, and fission of an active protein complex that guides cell division

Descrizione del progetto

Modellizzazione teorica dei meccanismi fondamentali della divisione cellulare

I meccanismi di posizionamento preciso del sito di divisione cellulare non sono del tutto chiari. Nel batterio Myxococcus xanthus (Mx), il cluster di proteine PomX/Y/Z si auto-assembla sulla superficie del nucleoide e trasloca nella cellula centrale per guidare l’apparato di divisione in modo dipendente dall’ATP. Il progetto PomXYZ, finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, svilupperà un modello teorico del processo, guidando l’apparato di divisione cellulare a metà cellula nel batterio Mx. Durante la divisione cellulare, il cluster Pom subisce una fissione e i cluster risultanti si trasferiscono al centro della cellula nelle cellule figlie per indurre ulteriori divisioni cellulari. I ricercatori impiegheranno un modello mesoscopico, che combina la dinamica spaziale con le reazioni stimolate localmente, per studiare la formazione, la traslocazione e la fissione dei cluster di Pom.

Obiettivo

In my research project I will theoretically model a fundamental process in the cell division of the model bacterium Myxococcus xanthus, namely the process for guiding the machinery for cell division to midcell. In M. xanthus, a cluster comprised of the proteins PomX, PomY, PomZ self-assembles on the nucleoid surface and in an ATP-consuming reaction cycle translocates to midcell, to guide the cell division machinery there. During cell division the Pom cluster undergoes fission, and the resulting two Pom clusters on the daughter cells again translocate to the respective midcell to induce further cell divisions. I will consider a mesoscopic model which combines spatial dynamics with locally stimulated reactions, to study the formation, translocation, and fission of the Pom cluster. My model is informed, and will be further refined, using experimental results of the group of Lotte Sgaard-Andersen at the MPI for Terrestrial Microbiology, an established collaborator of my supervisor Erwin Frey. I will quantify the constraints imposed on the protein-protein and protein-nucleoid interactions by the tasks the Pom cluster needs to fulfill (self-assembly, translocation, fission), and relate my mesoscopic model both to previously proposed heuristic models on Pom cluster translocation and to (stochastic) reaction-diffusion models. My project will lead to a deeper understanding of how biological systems actively create and maintain order. My mesoscopic model combines spatial dynamics with locally stimulated reactions, which are the two conceptual building blocks needed for spatial organization driven by energy consumption. My model will therefore be applicable also in other instances of biological self-organization, as well as in self-assembly of artificial nanostructures, both of which are active and growing research directions. My project will therefore make my research profile more impactful, which will help me to reach my goal of becoming an independent group leader.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -

Coordinatore

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Contributo netto dell'UE
€ 189 687,36
Indirizzo
GESCHWISTER SCHOLL PLATZ 1
80539 MUNCHEN
Germania

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Regione
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Istituti di istruzione secondaria o superiore
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato