Harmonising and Unifying Blood Metabolomic Analysis Networks

Informations projet

HUMAN

N° de convention de subvention: 101073062

DOI

10.3030/101073062

Date de signature de la CE 14 Juillet 2022

Date de début 1 Février 2023

Date de fin 31 Janvier 2027

Financé au titre de

• Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)

Coût total

Aucune donnée

Contribution de l’UE

€ 2 582 503,20

Coordonné par

ARISTOTELIO PANEPISTIMIO THESSALONIKIS
Greece

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Other (2)

Datasets of common sample set (pilot study) obtained on different LC-MS platforms

Datasets of common sample set (pilot study) obtained on different LC-MSplatforms

Definition and public advertisement of ESR positions

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website and communication strategy

Project website M2

Demonstrators, pilots, prototypes (4)

Kick-off conference (virtual)
Online information platform
OpenDays to engage with the public (M24)
Social media pages

Documents, reports (3)

Report from systematic literature review (meta-analysis)
Software package to represent, analyze and compare chromatographic MS data

Software package to represent, analyze and compare chromatographicMS data

Sample preparation method for nanoLC-MS based lipidomics

Publications

Peer reviewed articles (13)

Volumetric Absorptive Microsampling in the Analysis of Endogenous Metabolites

Auteurs: Daniel Marques de Sá e Silva, Marlene Thaitumu, Georgios Theodoridis, Michael Witting, Helen Gika
Publié dans: Metabolites, Numéro 13(10), 1038, 2023
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/METABO13101038

MetAssimulo 2.0: a web app for simulating realistic 1D and 2D metabolomic 1H NMR spectra

Auteurs: Yan Yan, Beatriz Jiménez, Michael T Judge, Toby Athersuch, Maria De Iorio, Timothy M D Ebbels
Publié dans: Bioinformatics, Numéro 41, 2025, ISSN 1367-4811
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF045

xcms at 20 and still in peak form: Anchoring a complete metabolomics data preprocessing and analysis software ecosystem

Auteurs: Philippine Louail, Carl Brunius, Mar Garcia-Aloy, William Kumler, Norman Storz, Jan Stanstrup, Hendrik Treutler, Pablo Vangeenderhuysen, Michael Witting, Steffen Neumann, Johannes Rainer
Publié dans: 2025, ISBN 2763927645
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.5C04338

MAMSI: Integration of Multiassay Liquid Chromatography–Mass Spectrometry Metabolomics Data Using Multiview Machine Learning

Auteurs: Lukas Kopecky; Caroline J. Sands; María Gómez-Romero; Shivani Misra; Elizabeth J. Want; Timothy M. D. Ebbels
Publié dans: Analytical Chemistry, 2025
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.5C01327

Resolution Enhancement of Metabolomic J-Res NMR Spectra Using Deep Learning

Auteurs: Yan Yan; Michael T. Judge; Toby Athersuch; Yuchen Xiang; Zhaolu Liu; Beatriz Jiménez; Timothy M. D. Ebbels
Publié dans: Analytical Chemistry, 2024
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.4C00563

Targeted and untargeted metabolomics and lipidomics in dried blood microsampling: Recent applications and perspectives

Auteurs: Pauline Couacault, Dennisse Avella, Sara Londoño‐Osorio, Ana S. Lorenzo, Ana Gradillas, Olli Kärkkäinen, Elizabeth Want, Michael Witting
Publié dans: Analytical Science Advances, Numéro 5, 2024, ISSN 2628-5452
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/ANSA.202400002

Integrating blood microsampling devices with CE-MS for untargeted analysis of polar metabolomics

Auteurs: Sara Londoño-Osorio, Daniel Marques de Sá Silva, Sara Martínez, Georgios Theodoridis, Ana Gradillas, Antonia García, Coral Barbas, Víctor González-Ruiz
Publié dans: Microchemical Journal, Numéro 218, 2025, ISSN 0026-265X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MICROC.2025.115278

Deep insights into microsampling technologies for global lipidomic profiling of human whole blood using high-throughput LC-MS

Auteurs: Sara Londoño-Osorio, Sara Martínez, Glykeria Avgerinou, Anatoli Petridou, Vassilis Mougios, Alma Villaseñor, Antonia García, Ana Gradillas, Coral Barbas
Publié dans: Microchemical Journal, Numéro 213, 2025, ISSN 0026-265X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MICROC.2025.113760

LC-MS-Based Global Metabolic Profiles of Alternative Blood Specimens Collected by Microsampling

Auteurs: Thaitumu, M.N.; De Sá e Silva, D.M.; Louail, P.; Rainer, J.; Avgerinou, G.; Petridou, A.; Mougios, V.; Theodoridis, G.; Gika
Publié dans: Metabolites, 2025
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/METABO15010062

Highly reliable LC-MS lipidomics database for efficient human plasma profiling based on NIST SRM 1950

Auteurs: Sara Martínez, Miguel García-Fernandez, Sara Londoño-Osorio, Ana Gradillas, Coral Barbas
Publié dans: Journal of Lipid Research, 2024
Éditeur: ELSEVIER
DOI: 10.1016/J.JLR.2024.100671

SpectriPy: Enhancing Cross-Language Mass Spectrometry Data Analysis with R and Python

Auteurs: Marilyn De Graeve, Wout Bittremieux, Thomas Naake, Carolin Huber, Matthias Anagho-Mattanovich, Nils Hoffmann, Pierre Marchal, Victor Chrone, Philippine Louail, Helge Hecht, Michael Witting, Johannes Rainer
Publié dans: Journal of Open Source Software, Numéro 10, 2025, ISSN 2475-9066
Éditeur: The Open Journal
DOI: 10.21105/JOSS.08070

Connecting the Dots: Bridging Microsamples and Conventional Blood Matrices in Metabolic Biomarker Analysis

Auteurs: Thaitumu, Marlene; Gkanali, Vasiliki; Theodoridis, Georgios; Gika, Helen
Publié dans: Analytical Science Advances, 2025
Éditeur: WILEY
DOI: 10.1002/ANSA.70044

Toward minimally invasive metabolomics: GC-MS metabolic fingerprints of dried blood microsamples in comparison to plasma

Auteurs: Daniel Marques de Sá e Silva, Marlene Thaitumu, Christina Virgiliou, Alexandra Tiganouria, Fernanda Rey-Stolle, Glykeria Avgerinou, Anatoli Petridou, Vasileios Mougios, Georgios Theodoridis, Helen Gika
Publié dans: The Analyst, Numéro 150, 2025, ISSN 0003-2654
Éditeur: Royal Society of Chemistry (RSC)
DOI: 10.1039/D5AN00937E

Book chapters (1)

Nontargeted Metabolomics Using the Sciex ZenoTOF 7600

Auteurs: Anna Artati, Pauline Couacault, Michael Witting
Publié dans: Methods in Molecular Biology, Metabolomics, 2025
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4534-5_1

Other (2)

Metabonaut: let's explore and learn to analyze untargeted metabolomics data

Auteurs: Philippine Louail, Marilyn De Graeve, Anna Tagliaferri, Vinicius Verri Hernandes, Daniel Marques de Sá e Silva, Johannes Rainer
Publié dans: 2025
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.15062929

Mapping the blood microsample metabolome

Auteurs: da Silva Marques, Daniel

Conference proceedings (1)

Streamlining LC-MS/MS Data Analysis in R with Open-Source xcms and RforMassSpectrometry: An End-to-End Workflow

Auteurs: Louail, Philippine; Tagliaferri, Anna; Verri Hernandes, Vinicius; Silva, Daniel M. S.; Rainer, Johannes
Publié dans: 2024
Éditeur: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.11370611