Harmonising and Unifying Blood Metabolomic Analysis Networks

Projektinformationen

HUMAN

ID Finanzhilfevereinbarung: 101073062

DOI

10.3030/101073062

EK-Unterschriftsdatum 14 Juli 2022

Startdatum 1 Februar 2023

Enddatum 31 Januar 2027

Finanziert unter

• Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)

Gesamtkosten

Keine Daten

EU-Beitrag

€ 2 582 503,20

Koordiniert durch

ARISTOTELIO PANEPISTIMIO THESSALONIKIS
Greece

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Other (2)

Datasets of common sample set (pilot study) obtained on different LC-MS platforms

Datasets of common sample set (pilot study) obtained on different LC-MSplatforms

Definition and public advertisement of ESR positions

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website and communication strategy

Project website M2

Demonstrators, pilots, prototypes (4)

Kick-off conference (virtual)
Online information platform
OpenDays to engage with the public (M24)
Social media pages

Documents, reports (3)

Report from systematic literature review (meta-analysis)
Software package to represent, analyze and compare chromatographic MS data

Software package to represent, analyze and compare chromatographicMS data

Sample preparation method for nanoLC-MS based lipidomics

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (13)

Volumetric Absorptive Microsampling in the Analysis of Endogenous Metabolites

Autoren: Daniel Marques de Sá e Silva, Marlene Thaitumu, Georgios Theodoridis, Michael Witting, Helen Gika
Veröffentlicht in: Metabolites, Ausgabe 13(10), 1038, 2023
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/METABO13101038

MetAssimulo 2.0: a web app for simulating realistic 1D and 2D metabolomic 1H NMR spectra

Autoren: Yan Yan, Beatriz Jiménez, Michael T Judge, Toby Athersuch, Maria De Iorio, Timothy M D Ebbels
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 41, 2025, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF045

xcms at 20 and still in peak form: Anchoring a complete metabolomics data preprocessing and analysis software ecosystem

Autoren: Philippine Louail, Carl Brunius, Mar Garcia-Aloy, William Kumler, Norman Storz, Jan Stanstrup, Hendrik Treutler, Pablo Vangeenderhuysen, Michael Witting, Steffen Neumann, Johannes Rainer
Veröffentlicht in: 2025, ISBN 2763927645
Herausgeber: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.5C04338

MAMSI: Integration of Multiassay Liquid Chromatography–Mass Spectrometry Metabolomics Data Using Multiview Machine Learning

Autoren: Lukas Kopecky; Caroline J. Sands; María Gómez-Romero; Shivani Misra; Elizabeth J. Want; Timothy M. D. Ebbels
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, 2025
Herausgeber: ACS
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.5C01327

Resolution Enhancement of Metabolomic J-Res NMR Spectra Using Deep Learning

Autoren: Yan Yan; Michael T. Judge; Toby Athersuch; Yuchen Xiang; Zhaolu Liu; Beatriz Jiménez; Timothy M. D. Ebbels
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, 2024
Herausgeber: ACS
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.4C00563

Targeted and untargeted metabolomics and lipidomics in dried blood microsampling: Recent applications and perspectives

Autoren: Pauline Couacault, Dennisse Avella, Sara Londoño‐Osorio, Ana S. Lorenzo, Ana Gradillas, Olli Kärkkäinen, Elizabeth Want, Michael Witting
Veröffentlicht in: Analytical Science Advances, Ausgabe 5, 2024, ISSN 2628-5452
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/ANSA.202400002

Integrating blood microsampling devices with CE-MS for untargeted analysis of polar metabolomics

Autoren: Sara Londoño-Osorio, Daniel Marques de Sá Silva, Sara Martínez, Georgios Theodoridis, Ana Gradillas, Antonia García, Coral Barbas, Víctor González-Ruiz
Veröffentlicht in: Microchemical Journal, Ausgabe 218, 2025, ISSN 0026-265X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MICROC.2025.115278

Deep insights into microsampling technologies for global lipidomic profiling of human whole blood using high-throughput LC-MS

Autoren: Sara Londoño-Osorio, Sara Martínez, Glykeria Avgerinou, Anatoli Petridou, Vassilis Mougios, Alma Villaseñor, Antonia García, Ana Gradillas, Coral Barbas
Veröffentlicht in: Microchemical Journal, Ausgabe 213, 2025, ISSN 0026-265X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MICROC.2025.113760

LC-MS-Based Global Metabolic Profiles of Alternative Blood Specimens Collected by Microsampling

Autoren: Thaitumu, M.N.; De Sá e Silva, D.M.; Louail, P.; Rainer, J.; Avgerinou, G.; Petridou, A.; Mougios, V.; Theodoridis, G.; Gika
Veröffentlicht in: Metabolites, 2025
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/METABO15010062

Highly reliable LC-MS lipidomics database for efficient human plasma profiling based on NIST SRM 1950

Autoren: Sara Martínez, Miguel García-Fernandez, Sara Londoño-Osorio, Ana Gradillas, Coral Barbas
Veröffentlicht in: Journal of Lipid Research, 2024
Herausgeber: ELSEVIER
DOI: 10.1016/J.JLR.2024.100671

SpectriPy: Enhancing Cross-Language Mass Spectrometry Data Analysis with R and Python

Autoren: Marilyn De Graeve, Wout Bittremieux, Thomas Naake, Carolin Huber, Matthias Anagho-Mattanovich, Nils Hoffmann, Pierre Marchal, Victor Chrone, Philippine Louail, Helge Hecht, Michael Witting, Johannes Rainer
Veröffentlicht in: Journal of Open Source Software, Ausgabe 10, 2025, ISSN 2475-9066
Herausgeber: The Open Journal
DOI: 10.21105/JOSS.08070

Connecting the Dots: Bridging Microsamples and Conventional Blood Matrices in Metabolic Biomarker Analysis

Autoren: Thaitumu, Marlene; Gkanali, Vasiliki; Theodoridis, Georgios; Gika, Helen
Veröffentlicht in: Analytical Science Advances, 2025
Herausgeber: WILEY
DOI: 10.1002/ANSA.70044

Toward minimally invasive metabolomics: GC-MS metabolic fingerprints of dried blood microsamples in comparison to plasma

Autoren: Daniel Marques de Sá e Silva, Marlene Thaitumu, Christina Virgiliou, Alexandra Tiganouria, Fernanda Rey-Stolle, Glykeria Avgerinou, Anatoli Petridou, Vasileios Mougios, Georgios Theodoridis, Helen Gika
Veröffentlicht in: The Analyst, Ausgabe 150, 2025, ISSN 0003-2654
Herausgeber: Royal Society of Chemistry (RSC)
DOI: 10.1039/D5AN00937E

Book chapters (1)

Nontargeted Metabolomics Using the Sciex ZenoTOF 7600

Autoren: Anna Artati, Pauline Couacault, Michael Witting
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, Metabolomics, 2025
Herausgeber: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4534-5_1

Other (2)

Metabonaut: let's explore and learn to analyze untargeted metabolomics data

Autoren: Philippine Louail, Marilyn De Graeve, Anna Tagliaferri, Vinicius Verri Hernandes, Daniel Marques de Sá e Silva, Johannes Rainer
Veröffentlicht in: 2025
Herausgeber: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.15062929

Mapping the blood microsample metabolome

Autoren: da Silva Marques, Daniel

Conference proceedings (1)

Streamlining LC-MS/MS Data Analysis in R with Open-Source xcms and RforMassSpectrometry: An End-to-End Workflow

Autoren: Louail, Philippine; Tagliaferri, Anna; Verri Hernandes, Vinicius; Silva, Daniel M. S.; Rainer, Johannes
Veröffentlicht in: 2024
Herausgeber: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.11370611