Harmonising and Unifying Blood Metabolomic Analysis Networks

Informacje na temat projektu

HUMAN

Identyfikator umowy o grant: 101073062

DOI

10.3030/101073062

Data podpisania przez KE 14 Lipca 2022

Data rozpoczęcia 1 Lutego 2023

Data zakończenia 31 Stycznia 2027

Finansowanie w ramach

• Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)

Koszt całkowity

Brak danych

Wkład UE

€ 2 582 503,20

Koordynowany przez

ARISTOTELIO PANEPISTIMIO THESSALONIKIS
Greece

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Other (2)

Datasets of common sample set (pilot study) obtained on different LC-MS platforms

Datasets of common sample set (pilot study) obtained on different LC-MSplatforms

Definition and public advertisement of ESR positions

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website and communication strategy

Project website M2

Demonstrators, pilots, prototypes (4)

Kick-off conference (virtual)
Online information platform
OpenDays to engage with the public (M24)
Social media pages

Documents, reports (3)

Report from systematic literature review (meta-analysis)
Software package to represent, analyze and compare chromatographic MS data

Software package to represent, analyze and compare chromatographicMS data

Sample preparation method for nanoLC-MS based lipidomics

Publikacje

Peer reviewed articles (13)

Volumetric Absorptive Microsampling in the Analysis of Endogenous Metabolites

Autorzy: Daniel Marques de Sá e Silva, Marlene Thaitumu, Georgios Theodoridis, Michael Witting, Helen Gika
Opublikowane w: Metabolites, Numer 13(10), 1038, 2023
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/METABO13101038

MetAssimulo 2.0: a web app for simulating realistic 1D and 2D metabolomic 1H NMR spectra

Autorzy: Yan Yan, Beatriz Jiménez, Michael T Judge, Toby Athersuch, Maria De Iorio, Timothy M D Ebbels
Opublikowane w: Bioinformatics, Numer 41, 2025, ISSN 1367-4811
Wydawca: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF045

xcms at 20 and still in peak form: Anchoring a complete metabolomics data preprocessing and analysis software ecosystem

Autorzy: Philippine Louail, Carl Brunius, Mar Garcia-Aloy, William Kumler, Norman Storz, Jan Stanstrup, Hendrik Treutler, Pablo Vangeenderhuysen, Michael Witting, Steffen Neumann, Johannes Rainer
Opublikowane w: 2025, ISBN 2763927645
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.5C04338

MAMSI: Integration of Multiassay Liquid Chromatography–Mass Spectrometry Metabolomics Data Using Multiview Machine Learning

Autorzy: Lukas Kopecky; Caroline J. Sands; María Gómez-Romero; Shivani Misra; Elizabeth J. Want; Timothy M. D. Ebbels
Opublikowane w: Analytical Chemistry, 2025
Wydawca: ACS
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.5C01327

Resolution Enhancement of Metabolomic J-Res NMR Spectra Using Deep Learning

Autorzy: Yan Yan; Michael T. Judge; Toby Athersuch; Yuchen Xiang; Zhaolu Liu; Beatriz Jiménez; Timothy M. D. Ebbels
Opublikowane w: Analytical Chemistry, 2024
Wydawca: ACS
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.4C00563

Targeted and untargeted metabolomics and lipidomics in dried blood microsampling: Recent applications and perspectives

Autorzy: Pauline Couacault, Dennisse Avella, Sara Londoño‐Osorio, Ana S. Lorenzo, Ana Gradillas, Olli Kärkkäinen, Elizabeth Want, Michael Witting
Opublikowane w: Analytical Science Advances, Numer 5, 2024, ISSN 2628-5452
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/ANSA.202400002

Integrating blood microsampling devices with CE-MS for untargeted analysis of polar metabolomics

Autorzy: Sara Londoño-Osorio, Daniel Marques de Sá Silva, Sara Martínez, Georgios Theodoridis, Ana Gradillas, Antonia García, Coral Barbas, Víctor González-Ruiz
Opublikowane w: Microchemical Journal, Numer 218, 2025, ISSN 0026-265X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MICROC.2025.115278

Deep insights into microsampling technologies for global lipidomic profiling of human whole blood using high-throughput LC-MS

Autorzy: Sara Londoño-Osorio, Sara Martínez, Glykeria Avgerinou, Anatoli Petridou, Vassilis Mougios, Alma Villaseñor, Antonia García, Ana Gradillas, Coral Barbas
Opublikowane w: Microchemical Journal, Numer 213, 2025, ISSN 0026-265X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MICROC.2025.113760

LC-MS-Based Global Metabolic Profiles of Alternative Blood Specimens Collected by Microsampling

Autorzy: Thaitumu, M.N.; De Sá e Silva, D.M.; Louail, P.; Rainer, J.; Avgerinou, G.; Petridou, A.; Mougios, V.; Theodoridis, G.; Gika
Opublikowane w: Metabolites, 2025
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/METABO15010062

Highly reliable LC-MS lipidomics database for efficient human plasma profiling based on NIST SRM 1950

Autorzy: Sara Martínez, Miguel García-Fernandez, Sara Londoño-Osorio, Ana Gradillas, Coral Barbas
Opublikowane w: Journal of Lipid Research, 2024
Wydawca: ELSEVIER
DOI: 10.1016/J.JLR.2024.100671

SpectriPy: Enhancing Cross-Language Mass Spectrometry Data Analysis with R and Python

Autorzy: Marilyn De Graeve, Wout Bittremieux, Thomas Naake, Carolin Huber, Matthias Anagho-Mattanovich, Nils Hoffmann, Pierre Marchal, Victor Chrone, Philippine Louail, Helge Hecht, Michael Witting, Johannes Rainer
Opublikowane w: Journal of Open Source Software, Numer 10, 2025, ISSN 2475-9066
Wydawca: The Open Journal
DOI: 10.21105/JOSS.08070

Connecting the Dots: Bridging Microsamples and Conventional Blood Matrices in Metabolic Biomarker Analysis

Autorzy: Thaitumu, Marlene; Gkanali, Vasiliki; Theodoridis, Georgios; Gika, Helen
Opublikowane w: Analytical Science Advances, 2025
Wydawca: WILEY
DOI: 10.1002/ANSA.70044

Toward minimally invasive metabolomics: GC-MS metabolic fingerprints of dried blood microsamples in comparison to plasma

Autorzy: Daniel Marques de Sá e Silva, Marlene Thaitumu, Christina Virgiliou, Alexandra Tiganouria, Fernanda Rey-Stolle, Glykeria Avgerinou, Anatoli Petridou, Vasileios Mougios, Georgios Theodoridis, Helen Gika
Opublikowane w: The Analyst, Numer 150, 2025, ISSN 0003-2654
Wydawca: Royal Society of Chemistry (RSC)
DOI: 10.1039/D5AN00937E

Book chapters (1)

Nontargeted Metabolomics Using the Sciex ZenoTOF 7600

Autorzy: Anna Artati, Pauline Couacault, Michael Witting
Opublikowane w: Methods in Molecular Biology, Metabolomics, 2025
Wydawca: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4534-5_1

Other (2)

Metabonaut: let's explore and learn to analyze untargeted metabolomics data

Autorzy: Philippine Louail, Marilyn De Graeve, Anna Tagliaferri, Vinicius Verri Hernandes, Daniel Marques de Sá e Silva, Johannes Rainer
Opublikowane w: 2025
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.15062929

Mapping the blood microsample metabolome

Autorzy: da Silva Marques, Daniel

Conference proceedings (1)

Streamlining LC-MS/MS Data Analysis in R with Open-Source xcms and RforMassSpectrometry: An End-to-End Workflow

Autorzy: Louail, Philippine; Tagliaferri, Anna; Verri Hernandes, Vinicius; Silva, Daniel M. S.; Rainer, Johannes
Opublikowane w: 2024
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.11370611