A comprehensive CAD system based on radiologic- and pathologic-image biomarkers for diagnosis and prognosis of breast cancer relapse

Leistungen

Classification of malign breast tissue regions and molecular subtypes

Report on the work of task 3.1, related to the detection and classification of malign breast tissue regions.

Methods for identifying aggressive cancer types

Report summarizing the work performed in task 3.4, on a mathematical model to identify the most aggressive cancer subtypes, from rediological images

Biopsies, WSI preparation and quality issues accuracy

Report summarizing the activities in task 4.1, related to the specific procedures that ensure the quality of biopsioes, stains and WSI imaging

Breast tissue density biomarker

Report containing the progress of task 3.3, related to the development of a visual biomarker of the breast tissue density, needed in order to classify the molecular subtype of the detected cancer

Veröffentlichungen

Efficient Generation of Synthetic Breast CT Slices By Combining Generative and Super-Resolution Models

Autoren: Zhikai Yang, Mehdi Astaraki, Örjan Smedby, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Artificial Intelligence and Imaging for Diagnostic and Treatment Challenges in Breast Care, 2025
Herausgeber: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-77789-9_7

CE-DDIM: Conditional Efficient Diffusion Method for Cone-Beam CT Enhancement

Autoren: Zipei Zhang, Zhikai Yang, Mikko Saukkoriipi, Jaakko Sahlsten, Xinjue Wang, Rodrigo Moreno, Kimmo Kaski
Veröffentlicht in: ICASSP 2026 - 2026 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), 2026
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ICASSP55912.2026.11464976

Vision Transformers for Breast Cancer Histology Image Classification

Autoren: Baroni, G.L., Rasotto, L., Roitero, K., Siraj, A.H., Della Mea, V
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Ausgabe 14366, 2024, ISBN 978-3-031-51025-0
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/978-3-031-51026-7_2

Reconstruction of Breast Spectral CT with Multi-Material Decomposition using a Two-Stage Learned Primal-Dual Neural Network

Autoren: Zhikai Yang, Ruihan Huang, Örjan Smedby, and Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Fully3D conference 2025, 2025
Herausgeber: Fully3D conference 2025

MM + CD Fusion: Deep Learning-based 3D Multi-Modal Fusion for Early Pathological Complete Response Prediction in Breast Cancer

Autoren: Tewele W. Tareke, Neree Payan, Alexandre Cochet, Alain Lalande, Fabrice Meriaudeau
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Artificial Intelligence and Imaging for Diagnostic and Treatment Challenges in Breast Care, 2025
Herausgeber: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-032-05559-0_14

Deep Learning based Tissue Specific MRI-IVIM Parameter Estimation

Autoren: Jingyu Liu, Zhikai Yang, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM) Annual Meeting, Ausgabe 5149, 2025
Herausgeber: ISMRM

Optimising Region of Interest Registration for Multiple-Tissue Whole Slide Images

Autoren: Alessio Fiorin, Laia Adalid Llansa, Elena Goyda, Vincenzo Della Mea, Anna Korzynska, Shrief Abdelazeez, Ramon Bosch Príncep, Alba Fischer Carles, Noelia Gallardo Borràs, Marylène Lejeune, Daniel Mata Cano, Domenec Puig, Hatem A. Rashwan, Esther Sauras Colón, Mikel Relloso Ortiz de Uriarte, Laia Reverté Calvet, Carlos López Pablo
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Biomedical Image Registration, 2024
Herausgeber: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-73480-9_26

Fine-tuning Specialized NER Model for Symptom Extraction from Slovenian Medical Texts

Autoren: Rigon Sallauka, Umut Arioz, Izidor Mlakar
Veröffentlicht in: 2024 9th International Conference on Mathematics and Computers in Sciences and Industry (MCSI), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/MCSI63438.2024.00032

Tumor-Aware Conditional Pix2PixHD with Per-Image Normalization for Virtual Contrast Enhancement in Breast MR

Autoren: Hong Jiang, Zhikai Yang, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Proc. 3rd Deep Breast Workshop on AI and Imaging for Diagnostic and Treatment Challenges in breast care, 2026
Herausgeber: Springer

Automated Radiomics Analysis from Multi-Modal Image Segmentation for Predicting Triple Negative Breast Cancer

Autoren: Tewele W. Tareke, Neree Payan, Alexandre Cochet, Yaqeen Ali, Laurent Arnould, Benoît Presles, Jean-Marc Vrigneaud, Fabrice Meriaudeau, Alain Lalande
Veröffentlicht in: 2025 47th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/EMBC58623.2025.11252611

Predicting pathological complete response in breast cancer using a dual 3D ResNet‑transformer architecture with multimodal data fusion

Autoren: Yaqeen Ali, Julia Müller, Tewele W. Tareke, Alain Lalande, Fabrice Meriaudeau, Johannes Gregori
Veröffentlicht in: Medical Imaging 2026: Computer-Aided Diagnosis, 2026
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3087618

Multiscale Subtraction Consistency-based Generative Adversarial Networks for Contrast-Agent-Free Breast DCE-MRI Synthesis

Autoren: Zhikai Yang, Cristina Zhang, Muzhen He, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Proc. International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM) Annual Meeting, 2026
Herausgeber: ISMRM

The BosomShield project: an integrative approach to diagnosis and prognosis of breast cancer relapse based on radiologic / pathologic image biomarkers

Autoren: Hatem A. Rashwan, Vincenzo Della Mea, Rodrigo Moreno, Ioannis Sechopoulos, Carlos López, Anna Korzyńska, Alain Lalande, Izidor Mlakar, Zouhair Haddi, Johannes Gregori, Domenec Puig
Veröffentlicht in: ECDP2023 19thEuropean Congress on Digital Pathology, 2023

Deep Learning-Driven Radiomic Feature Extraction for Predicting Complete Pathological Response to Neoadjuvant Chemotherapy in Breast Cancer from <sup>18</sup> F

Autoren: Tewele W. Tareke, Neree Payan, Alexandre Cochet, Laurent Arnould, Benoît Presles, Jean-Marc Vrigneaud, Soumya Ghose, Fabrice Meriaudeau, Alain Lalande
Veröffentlicht in: 2025 47th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/EMBC58623.2025.11253253

Multi-parametric MRI for Contrast Agent Free Breast DCE-MRI Synthesis

Autoren: Zhikai Yang, Cristina Zhang, Huijian Chen, Muzhen He, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Proc. MICCAI, 2026
Herausgeber: Springer

Lesion localization in digital breast tomosynthesis with deformable transformers by using 2.5D information

Autoren: Zhikai Yang, Tianyu Fan, Örjan Smedby, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Medical Imaging 2024: Computer-Aided Diagnosis, Ausgabe 28, 2024
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3005496

Memory Efficient Two-Stage Diffusion Model in Synthetic Breast Image Generation

Autoren: Zhikai Yang, Örjan Smedby, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: European Conference of Radiology, 2024
Herausgeber: ECR
DOI: 10.26044/ecr2024/C-24121

Vision Transformers for Breast Cancer Classification

Autoren: G.L. Baroni, L. Rasotto, K. Roitero, A. Tulisso, M. Orsaria, C. Di Loreto, V. Della Mea
Veröffentlicht in: ECDP2024, 2024

Using simulated breast lesions based on Perlin noise for evaluation of lesion segmentation

Autoren: Hanna Tomic, Zhikai Yang, Anders Tingberg, Sophia Zackrisson, Rodrigo Moreno, Örjan Smedby, Magnus Dustler, Predrag Bakic
Veröffentlicht in: Medical Imaging 2024: Physics of Medical Imaging, Ausgabe 10718, 2024
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3008840

3D breast ultrasound image classification using 2.5D deep learning

Autoren: Zhikai Yang, Tianyu Fan, Örjan Smedby, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: 17th International Workshop on Breast Imaging (IWBI 2024), 2024
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3025534

Comparison of lesion segmentation methodsusing simulated DBT images

Autoren: Zhikai Yang, Hanna Tomic, Victor Dahlblom, Sophia Zackrisson, Anders Tingberg, Magnus Dustler, Örjan Smedby, Rodrigo Moreno and Predrag Bakic
Veröffentlicht in: Proceedings Virtual Imaging Trials in Medicine 2024, Ausgabe Page 195, 2024
Herausgeber: VITM 2024
DOI: 10.48550/arXiv.2405.05359

Two-stage convolutional neural network for breast CT reconstruction

Autoren: Zhikai Yang, Yihan Xiao, Ozan Öktem, Örjan Smedby, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Medical Imaging 2025: Physics of Medical Imaging, 2025
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3048825

Explainable and fair federated learning with XGBoost for predicting pathological complete response in breast cancer using multicenter DCE‑MRI data

Autoren: Yaqeen Ali, Julia Müller, Andreas Weinmann, Johannes Gregori
Veröffentlicht in: Medical Imaging 2026: Computer-Aided Diagnosis, 2026
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3085564

Exploiting Multiple Phases of DCE MRI for Breast Cancer Pre-treatment Pathological Complete Response Prediction

Autoren: Zhikai Yang, Guangyuan Li,Örjan Smedby, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: International Workshop on Breast Imaging, 2026
Herausgeber: SPIE

Physics-Informed Neural Network for T2 and M0 Map Estimation

Autoren: Zhikai Yang, Lorenzo Branca, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: ESMRMB Annual Scientific Meeting 2023, 2023
Herausgeber: ESMRMB

Transformer-Based Foundation Model for Universal Ultrasound Image Analysis

Autoren: Zhikai Yang, Junjie Hu, Félix Nieto-del-Amor, Guangyuan Li, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: 2026 IEEE 23rd International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2026
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ISBI61048.2026.11515490

Leveraging MRI Radiomics and Machine Learning for Accurate Differentiation of Triple-Negative Breast Cancer Subtype

Autoren: Yaqeen Ali, Johannes Gregori, Tewele W. Tareke, Alain Lalande, Fabrice Meriaudeau
Veröffentlicht in: 2025 IEEE 38th International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/CBMS65348.2025.00185

Scoping review: (Bio)markers for the prognostication of breast cancer recurrence

Autoren: Sallauka, Rigon; Horvat, Matej; Ravnik, Maja; Rashwan, Hatem; Arioz, Umut; Mlakar, Izidor
Veröffentlicht in: BMC Cancer, 2025
Herausgeber: SPRINGER NATURE LINK
DOI: 10.1186/S12885-025-14515-Z

Deep learning framework integrating 18F-FDG PET/CT and clinical data for early prediction of chemotherapy response in advanced breast cancer

Autoren: Tewele W. Tareke, Neree Payan, Alexandre Cochet, Alain Lalande, Fabrice Meriaudeau
Veröffentlicht in: Biomedical Signal Processing and Control, Ausgabe 121, 2026, ISSN 1746-8094
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.BSPC.2026.110254

MAIA: a collaborative medical AI platform for integrated healthcare innovation

Autoren: Simone Bendazzoli, Sanna Persson, Mehdi Astaraki, Sebastian Pettersson, Vitali Grozman, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: npj Artificial Intelligence, Ausgabe 1, 2025, ISSN 3005-1460
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S44387-025-00042-6

Enhancing AI Research for Breast Cancer: A Comprehensive Review of Tumor-Infiltrating Lymphocyte Datasets

Autoren: Alessio Fiorin; Carlos López Pablo; Marylène Lejeune; Ameer Hamza Siraj; Vincenzo Della Mea
Veröffentlicht in: Crossref, 2024
Herausgeber: SPRINGER NATURE
DOI: 10.1007/S10278-024-01043-8

Morphology-enhanced CAM-guided SAM for weakly supervised breast lesion segmentation

Autoren: Xin Yue, Qing Zhao, Xiaoling Liu, Jianqiang Li, Jing Bai, Changwei Song, Suqin Liu, Rodrigo Moreno, Zhikai Yang, Stefano E. Romero, Gabriel Jimenez, Guanghui Fu
Veröffentlicht in: Biomedical Signal Processing and Control, Ausgabe 116, 2026, ISSN 1746-8094
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.BSPC.2026.109509

Automatic computation of breast cancer biomarkers from multiple $$^{18}$$ F-FDG PET image segmentation

Autoren: Tewele W. Tareke, Neree Payan, Alexandre Cochet, Laurent Arnould, Benoît Presles, Jean-Marc Vrigneaud, Fabrice Meriaudeau, Alain Lalande
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2026, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41598-026-50945-W

Histological Hyperspectral Breast Cancer Recurrence Database (HistologyHSI-BC Recurrence)

Autoren: Laura Quintana-Quintana, Esther Sauras-Colón, Alessio Fiorin, Javier Santana-Nunez, Samuel Ortega, Noèlia Gallardo-Borràs, Alba Fischer-Carles, Tábata Sánchez-Alcántara, Himar Fabelo, Laia Adalid-Llansa, Daniel Mata-Cano, Ramon Bosch-Príncep, Marylène Lejeune, Gustavo M. Callico, Carlos López-Pablo
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 12, 2025, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41597-025-06157-4

Influence of the Molecular Subtype-Dependent Immune Microenvironment of Metastatic Axillary Lymph Nodes on Breast Cancer Patient Outcomes

Autoren: Carlos López, Laia Reverté, Ramon Bosch Príncep, Esther Sauras, Noèlia Gallardo-Borràs, Alba Fischer-Carles, Anna Korzynska, Marcial García-Rojo, Gloria Bueno, Lukasz Roszkowiak, Albert Roso-LLorach, Andrea Gras Navarro, Montserrat Llobera, Daniel Mata, Laia Adalid Llansa, Salomé Martínez-González, Joan F. Garcia-Fontgivell, Meritxell Arenas, Junior Gómez, José Antonio Izuel, Jordi Baucells, Marylène Lejeune
Veröffentlicht in: Pathobiology, Ausgabe 93, 2026, ISSN 1015-2008
Herausgeber: S. Karger AG
DOI: 10.1159/000550086

Weakly-Supervised Multilingual Medical NER for Symptom Extraction for Low-Resource Languages

Autoren: Rigon Sallauka, Umut Arioz, Matej Rojc, Izidor Mlakar
Veröffentlicht in: Applied Sciences, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2076-3417
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/APP15105585

Leveraging immune and clinicopathological profiles with machine learning to predict axillary lymph node metastasis in breast cancer patients

Autoren: Alba Fischer-Carles, Alessio Fiorin, Carlos López Pablo, Laia Reverté, Esther Sauras-Colón, Noèlia Gallardo-Borràs, Marylène Lejeune, Mikel Relloso Ortiz de Uriarte, Tábata Sánchez-Alcántara, Maria Ballester-Navarro, Ramon Bosch Príncep, Laia Adalid-Llansa, Elena Goyda, Daniel Mata Cano, Jérôme Noailly, Gemma Piella
Veröffentlicht in: Breast Cancer Research, Ausgabe 28, 2026, ISSN 1465-542X
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S13058-026-02294-9

Optimizing Vision Transformers for Histopathology: Pretraining and Normalization in Breast Cancer Classification

Autoren: Giulia Lucrezia Baroni, Laura Rasotto, Kevin Roitero, Angelica Tulisso, Carla Di Loreto, Vincenzo Della Mea
Veröffentlicht in: Journal of Imaging, Ausgabe 10, 2024, ISSN 2313-433X
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/jimaging10050108

Combining shallow and deep neural networks on pseudo-color enhanced images for digital breast tomosynthesis lesion classification

Autoren: Zhikai Yang, Yingqing Liu, Örjan Smedby, Rodrigo Moreno
Veröffentlicht in: Frontiers in Digital Health, Ausgabe 7, 2026, ISSN 2673-253X
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FDGTH.2025.1705044

Enhancing AI Research for Breast Cancer: A Comprehensive Review of Tumor‑Infiltrating Lymphocyte Datasets

Veröffentlicht in: Journal of Imaging Informatics in Medicine, 2024, ISSN 2948-2933
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s10278-024-01043-8

FedGA: Genetic Algorithm-Guided Federated Learning for Medical Image Segmentation with Non-IID Features

Autoren: Faisal Ahmed, Rodrigo Moreno, David Sánchez, Zouhair Haddi, Josep Domingo-Ferrer
Veröffentlicht in: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2026, ISSN 2168-2194
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.1109/JBHI.2026.3676321

Performance of federated versus centralized learning for mammography classification across film–digital domain shift

Autoren: Yaqeen Ali, Julia Müller, Andreas Weinmann, Johannes Gregori
Veröffentlicht in: Frontiers in Digital Health, Ausgabe 8, 2026, ISSN 2673-253X
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FDGTH.2026.1715858

Lightweight multiscale feature refinement network for breast cancer histopathology segmentation

Autoren: Zaka-Ud-Din Muhammad, Vincenzo Della Mea
Veröffentlicht in: Informatics in Medicine Unlocked, Ausgabe 63, 2026, ISSN 2352-9148
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IMU.2026.101754

Longitudinal evaluation of tumor-infiltrating lymphocyte scoring using automated region of interest registration in breast cancer

Autoren: Alessio Fiorin, Laia Adalid-Llansa, Laia Reverté, Esther Sauras-Colón, Noèlia Gallardo-Borràs, Hatem A. Rashwan, Ramon Bosch-Príncep, Alba Fischer-Carles, Elena Goyda, Marylène Lejeune, Daniel Mata-Cano, Domènec Puig, Tábata Sánchez-Alcántara, Mikel Relloso Ortiz de Uriarte, Montserrat Llobera-Serentill, José Antonio Izuel-Navarro, Carlos López-Pablo
Veröffentlicht in: Breast Cancer Research, 2026, ISSN 1465-542X
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S13058-026-02333-5

A modular deep learning pipeline for stromal TILs scoring in breast cancer H&E slides

Autoren: Shrief Abdelazeez, Faisal Ahmed, Laia Adalid, Krzysztof Siemion, Carlos Lopez, Marylene Lejeune, Hatem Rashwan, Anna Korzynska
Veröffentlicht in: Computer Methods and Programs in Biomedicine, Ausgabe 282, 2026, ISSN 0169-2607
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CMPB.2026.109374

Retrospective Case‐Cohort Study on Risk Factors for Developing Distant Metastases in Women With Breast Cancer

Autoren: Serena Bertozzi, Ambrogio Pietro Londero, Giovanni Vendramelli, Maria Orsaria, Laura Mariuzzi, Enrico Pegolo, Carla Di Loreto, Carla Cedolini, Vincenzo Della Mea
Veröffentlicht in: Cancer Medicine, Ausgabe 14, 2025, ISSN 2045-7634
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/CAM4.70903

UWarp: A Whole Slide Image Registration Pipeline to Characterize Scanner-Induced Local Domain Shift

Autoren: Antoine Schieb, Bilal Hadjadji, Natalia Fernanda Valderrama Barrera, Daniel Tshokola Mweze, Valentin Derangère, Laurent Arnould, Sylvain Ladoire, Alain Lalande, Alessio Fiorin, Carlos López Pablo, Noèlia Gallardo-Borràs, Shrief Abdelazeez, Vincenzo Della Mea, Anna Korzyńska, Nathan Vinçon, Louis-Oscar Morel
Veröffentlicht in: IEEE Access, Ausgabe 14, 2026, ISSN 2169-3536
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.1109/ACCESS.2026.3698161

AI-based framework pipeline for stromal tumor infiltrating lymphocytes quantification in H&E stained breast cancer histopathological images

Autoren: Shrief Abdelazeez, Alessio Fiorin, Vincenzo Della Mea, Laia Adalid, Krzysztof Siemion, Carlos Lopez, Marylene Lejeune, Anna Korzynska
Veröffentlicht in: Biomedical Signal Processing and Control, Ausgabe 120, 2026, ISSN 1746-8094
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.BSPC.2026.110003

Projektergebnisse

Leistungen

Veröffentlichungen

Herunterladen Den Inhalt der Seite herunterladen