Descripción del proyecto
Comprensión de la arquitectura genómica intercromosómica y la interacción de la biogénesis del ARN mensajero
A pesar de los avances en el mapeo cromosómico, el conocimiento sobre la estructura tridimensional del genoma y las interacciones entre cromosomas sigue siendo limitado. Investigaciones recientes han descrito una «fábrica de corte y empalme» en el que participan más de diez cromosomas, coordinado por la proteína RBM20 alrededor del pre-ARN mensajero (ARNm) de TTN. La hipótesis que subyace a este hallazgo es que la biogénesis del ARNm influye en la formación de dominios cromatínicos que interactúan entre cromosomas y facilitan la regulación génica. En el proyecto TRANS-3, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se analizarán genomas intercromosómicos centrándose en la «fábrica de corte y empalme» de ARNm RBM20. En este sentido, se examinará cómo se establece esta fábrica y sus funciones fisiológicas, en concreto en relación con mutaciones en RBM20 y GATA4. También se desarrollará un método para identificar nuevos elementos reguladores de la transcripción y «fábricas» de ARNm, y se mejorará la comprensión de la estructura y función nucleares.
Objetivo
In TRANS-3 we will develop the theoretical and experimental framework to understand inter-chromosomal genome structure and activity. Despite advances in sequencing chromosomes and mapping their three dimensional (3D) organization, a full picture of 3D genome structure that details how the borders of various chromosome territories functionally interface one another is still missing. As an analogy, our world map does not indicate most natural corridors or manmade infrastructure that connect countries to one another. Worse, we barely understand how such connections function. My recent work has identified one of the few functional inter-chromosomal (trans) DNA interactions known to date: a splicing factory involving over ten chromosomes and orchestrated by the muscle-specific protein RBM20 around its key target, the TTN pre-mRNA. I hypothesize that this exemplifies how mRNA biogenesis instructs the formation of trans-interacting chromatin domains (TIDs) around mRNA factories, nuclear compartments that facilitate gene regulation. We will test this general hypothesis by dissecting the mechanisms and function of a specific, disease-relevant model: the RBM20 mRNA splicing factory. We will then explore the global impact of these regulations. First (WP1) we will mechanistically assess how mRNA factories form and act through live imaging of the nuclear positioning and alternative splicing dynamics of an RBM20-regulated locus. Secondly (WP2) we will examine the physiological role of mRNA factories by studying the effects of disease-associated mutations in RBM20 and the TTN regulator GATA4, and of genetic variability in TTN regulatory regions. Finally (WP3) we will develop and deploy a novel pipeline to identify, validate, and study new TIDs and mRNA factories through the combination of molecular biology, bioinformatics, biochemistry, and single cell biology. In all, TRANS-3 will venture beyond the chromosome frontier towards a deeper understanding of nuclear structure-function.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2022-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
10124 TORINO
Italia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.