Description du projet
Compréhension de l’architecture génomique interchromosomique et de l’interaction avec la biogenèse de l’ARNm
Malgré les progrès réalisés dans la cartographie chromosomique, notre compréhension de la structure tridimensionnelle du génome et des interactions entre les chromosomes est limitée. Des recherches récentes ont permis de découvrir une usine d’épissage impliquant plus de dix chromosomes, coordonnée par la protéine RBM20 autour du pré-ARNm TTN. On suppose que cette découverte indique que la biogenèse de l’ARNm influence la formation de domaines chromatiniens interagissant entre eux, ce qui facilite la régulation des gènes. Le projet TRANS-3, financé par le CER, permettra de comprendre les génomes inter-chromosomiques en se concentrant sur l’usine d’épissage de l’ARNm RBM20. Il examinera la formation de ces usines et leurs rôles physiologiques, en particulier en relation avec les mutations de RBM20 et de GATA4. Le projet établira également un pipeline pour identifier de nouveaux éléments de régulation de la transcription et des usines d’ARNm, et améliorera notre compréhension de la structure et de la fonction nucléaires.
Objectif
In TRANS-3 we will develop the theoretical and experimental framework to understand inter-chromosomal genome structure and activity. Despite advances in sequencing chromosomes and mapping their three dimensional (3D) organization, a full picture of 3D genome structure that details how the borders of various chromosome territories functionally interface one another is still missing. As an analogy, our world map does not indicate most natural corridors or manmade infrastructure that connect countries to one another. Worse, we barely understand how such connections function. My recent work has identified one of the few functional inter-chromosomal (trans) DNA interactions known to date: a splicing factory involving over ten chromosomes and orchestrated by the muscle-specific protein RBM20 around its key target, the TTN pre-mRNA. I hypothesize that this exemplifies how mRNA biogenesis instructs the formation of trans-interacting chromatin domains (TIDs) around mRNA factories, nuclear compartments that facilitate gene regulation. We will test this general hypothesis by dissecting the mechanisms and function of a specific, disease-relevant model: the RBM20 mRNA splicing factory. We will then explore the global impact of these regulations. First (WP1) we will mechanistically assess how mRNA factories form and act through live imaging of the nuclear positioning and alternative splicing dynamics of an RBM20-regulated locus. Secondly (WP2) we will examine the physiological role of mRNA factories by studying the effects of disease-associated mutations in RBM20 and the TTN regulator GATA4, and of genetic variability in TTN regulatory regions. Finally (WP3) we will develop and deploy a novel pipeline to identify, validate, and study new TIDs and mRNA factories through the combination of molecular biology, bioinformatics, biochemistry, and single cell biology. In all, TRANS-3 will venture beyond the chromosome frontier towards a deeper understanding of nuclear structure-function.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
10124 TORINO
Italie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.