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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Uncovering the role and regulation of 3D DNA-RNA nuclear dynamics in controlling cell fate decisions

Objetivo

At the onset of mammalian life, the first lineage specification decision is made where embryonic cells opt to
become either part of the placenta or the future body. Proper regulation of this choice is crucial for subsequent
development. However, we dont know how the transcription program and 3D genome architecture arise,
interconnect, and are controlled to determine the fate of each cell in a developing embryo. Recent studies,
including my work, suggest that in addition to canonical mRNA-coding genes, RNAs from the dark parts of
the genome (e.g. transposons, repeats, long-non-coding RNAs) play a significant role during these events, yet
how specific classes of RNA regulate gene expression and nuclear architecture post fertilization remains
elusive. The main aim of my proposal is to understand the interrelationship between 3D genome organization
and the transcriptome across early development and to identify novel factors that lead to the first cell-fate
decision and concomitant decrease in cell potency.
Recent technical advances, which I co-developed, enabled simultaneous measurement of 3D genome
organization and the transcriptome, and facilitated large-scale functional screens in early mammalian embryos.
Thus, I now propose to generate spatiotemporal maps of 3D DNA and RNA organization from early mouse
embryos at single-cell resolution (Obj.1) to build a complete picture of the relationships between nuclear
architecture and emerging cell-type specific transcriptome that drive early cell fate choices. I will combine
these data with large-scale in vivo perturbations targeting protein coding genes (Obj.2) and dark genome
RNAs (Obj.3) to identify key inducers/regulators of lineage specification and to determine molecular
mechanisms governing cell-state transitions. The proposed research will help us to control, correct, and
eventually employ early stages of embryonic development and their high cell potency in vitro in reproductive
medicine and stem cell research.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2022-STG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 1 500 000,00
Dirección
DR BOHRGASSE 3
1030 WIEN
Austria

Ver en el mapa

Región
Ostösterreich Wien Wien
Tipo de actividad
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 1 500 000,00

Beneficiarios (1)

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