Objectif
At the onset of mammalian life, the first lineage specification decision is made where embryonic cells opt to
become either part of the placenta or the future body. Proper regulation of this choice is crucial for subsequent
development. However, we dont know how the transcription program and 3D genome architecture arise,
interconnect, and are controlled to determine the fate of each cell in a developing embryo. Recent studies,
including my work, suggest that in addition to canonical mRNA-coding genes, RNAs from the dark parts of
the genome (e.g. transposons, repeats, long-non-coding RNAs) play a significant role during these events, yet
how specific classes of RNA regulate gene expression and nuclear architecture post fertilization remains
elusive. The main aim of my proposal is to understand the interrelationship between 3D genome organization
and the transcriptome across early development and to identify novel factors that lead to the first cell-fate
decision and concomitant decrease in cell potency.
Recent technical advances, which I co-developed, enabled simultaneous measurement of 3D genome
organization and the transcriptome, and facilitated large-scale functional screens in early mammalian embryos.
Thus, I now propose to generate spatiotemporal maps of 3D DNA and RNA organization from early mouse
embryos at single-cell resolution (Obj.1) to build a complete picture of the relationships between nuclear
architecture and emerging cell-type specific transcriptome that drive early cell fate choices. I will combine
these data with large-scale in vivo perturbations targeting protein coding genes (Obj.2) and dark genome
RNAs (Obj.3) to identify key inducers/regulators of lineage specification and to determine molecular
mechanisms governing cell-state transitions. The proposed research will help us to control, correct, and
eventually employ early stages of embryonic development and their high cell potency in vitro in reproductive
medicine and stem cell research.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine clinique obstétrique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine clinique embryologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1030 WIEN
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.