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Evolutionary dynamics of genomic erosion and its application in biodiversity conservation

Description du projet

Étude de l’incidence de l’érosion génomique sur la biodiversité

L’action de l’homme a dégradé la biodiversité partout dans le monde. De nombreuses populations sauvages suivent une trajectoire de déclin et, malheureusement, le fait de ralentir ou d’inverser cette tendance ne suffira pas à rétablir la santé des populations sauvages à long terme. Ce phénomène est dû en partie à l’érosion génomique, c’est-à-dire à la perte chez les populations sauvages de la diversité génétique nécessaire pour assurer leur résilience. Pour y remédier, le projet ERODE, financé par l’UE, se penchera sur les effets de l’érosion génomique et élaborera des solutions potentielles pour la prévenir ou l’endiguer. Le projet se concentrera d’abord sur l’étude des changements génomiques survenus chez trois espèces d’oiseaux menacées au cours des trois dernières décennies. Ses résultats serviront à élaborer des modèles informatiques et à identifier les moyens de conserver et de restaurer la biodiversité pour les générations futures.

Objectif

Reducing biodiversity loss is one of the most pressing societal challenges of our time. Population decline has put many species on the path of collapse and extinction. Reducing or reversing this decline is not enough to tackle the associated hidden evolutionary costs, most notably genomic erosion which compromises the long-term viability and resilience of species. ERODE will employ state-of-the-art approaches – (paleo)genomics, quantitative genomics, and evolutionary modelling – to assess the dynamics of genomic erosion on neutral, beneficial, and deleterious variation and understand its effects on organismal fitness, population viability, and extinction risk. I will perform one of the most comprehensive genome-fitness studies to date by examining the fitness effects of genomic erosion over time in 6,530 individuals of three iconic endangered bird species for which I have access to over 30 years of genetic samples and fitness data. Together with zooarchaeological and museum-preserved samples, I will draw a dynamic timeline of genomic erosion in response to population decline. Next, I will develop a modelling framework parametrized and validated with empirical data to predict the consequences of genomic erosion. I will use this framework to understand the efficacy of in-situ and ex-situ conservation strategies in collaboration with The European Association of Zoos and Aquaria (EAZA). The computer model will incorporate genomics into the Green Status of Species to evaluate species recovery and conservation impact, in collaboration with members of the International Union for Conservation of Nature (IUCN). ERODE will produce one of the largest genomic datasets for endangered species in the world and a robust modelling framework for conservation scientists and practitioners. The outputs will be disseminated in academic journals but also over a series of workshops, instruction videos and other outreach activities, which will support their practical application.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. La classification de ce projet a été validée par l’équipe qui en a la charge.

Régime de financement

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Institution d’accueil

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contribution nette de l'UE
€ 1 500 000,00
Coût total
€ 1 500 000,00

Bénéficiaires (1)