Description du projet
Comprendre le code de la coiffe non canonique
Les ARNm sont régulés par leur séquence, leur promoteur et leurs modifications. La coiffe 5’ (m7G) est la modification la plus connue, jouant un rôle dans la stabilité et la traduction de l’ARNm. Cependant, la récente découverte de coiffes non canoniques, comme la NAD+ et la NADH, suggère l’existence d’un «code des coiffes» complexe. Les méthodes actuelles destinées à identifier les structures des coiffes sont limitées. Le projet MaDCap, financé par le CER, vise à résoudre ce problème en concevant une nouvelle méthode à molécule unique pour séquencer directement les coiffes natives et leurs transcriptions complètes d’ARN. Le projet caractérisera le «cap-ome» dans différents tissus et stades de développement, créant ainsi un atlas temporel et spatial détaillé des ARN à coiffe. Ces travaux permettront de découvrir les fonctions des coiffes non canoniques et de mieux comprendre leur code.
Objectif
From their creation to their degradation, mRNAs are under extensive regulation. This regulation is directed not only by their nucleotide sequence and their promoter but also by post- and co-transcriptional modifications attached to the RNA. One of the most ubiquitous of these modifications in eukaryotes is the 5' cap typically a methylated guanine (m7G) attached inversely to the first transcribed nucleotide. Several decades of research have revealed the m7G cap as an interface for regulating stability, splicing, polyadenylation, localization, and translation. The m7G cap was long presumed to be the only functional cap in eukaryotes, but this view was recently overturned by the discovery of the non-canonical nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) cap. Following this, several other eukaryotic cap structures were discovered: NADH, flavin adenine dinucleotide (FAD), uridine diphosphate glucose (UDP-Glc), and uridine diphosphate N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc). The function of most non-canonical caps is unknown, but their presence suggests the existence of a regulatory cap code.
Currently, the complete cap structure can only be identified through bulk methods that cleave caps from their transcripts, thereby losing the link between mRNAs and their specific caps. For NAD-caps enrichment techniques exist that can be followed by sequencing, but no such method exists for other non-canonical caps, and no sequencing method exists that can identify more than one cap. This limitation is a significant obstacle in understanding the cap code and the function of its more enigmatic members.
The objective of this project is to 1) develop a novel single-molecule method that can directly sequence native caps with their full-length RNA transcripts, 2) use this method to characterize the cap-ome across tissues and development, and 3) use the resulting temporal and spatial atlas of capped RNAs to determine the function of non-canonical caps and understand the non-canonical cap code
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
0313 Oslo
Norvège
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.