Opis projektu
Zrozumienie niekanonicznego kodu czapeczki
Cząsteczki mRNA są regulowane przez ich sekwencję, promotor i modyfikacje. Czapeczka 5' (m7G) jest najbardziej znaną modyfikacją, która wpływa na stabilność i proces translacji mRNA. Niedawne odkrycie niekanonicznych czapeczek, takich jak NAD+ i NADH, sugerują istnienie złożonego „kodu czapeczek”. Konwencjonalne metody umożliwiające badanie ich struktur są ograniczone. Zespół finansowanego ze środków ERBN projektu MaDCap ma na celu rozwiązanie tego problemu poprzez opracowanie nowej metody cząsteczkowej do bezpośredniego sekwencjonowania czapeczek i kompletnych transkryptów ich RNA. W ramach projektu scharakteryzowany zostanie kod czapeczek w różnych tkankach i na różnych etapach rozwoju, co pozwoli na opracowanie szczegółowego czasowego i przestrzennego atlasu cząsteczek RNA z czapeczkami. Zespół zbada funkcje niekanonicznych czapeczek i zapewni wgląd w kod ich niekanonicznych wariantów.
Cel
From their creation to their degradation, mRNAs are under extensive regulation. This regulation is directed not only by their nucleotide sequence and their promoter but also by post- and co-transcriptional modifications attached to the RNA. One of the most ubiquitous of these modifications in eukaryotes is the 5' cap typically a methylated guanine (m7G) attached inversely to the first transcribed nucleotide. Several decades of research have revealed the m7G cap as an interface for regulating stability, splicing, polyadenylation, localization, and translation. The m7G cap was long presumed to be the only functional cap in eukaryotes, but this view was recently overturned by the discovery of the non-canonical nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) cap. Following this, several other eukaryotic cap structures were discovered: NADH, flavin adenine dinucleotide (FAD), uridine diphosphate glucose (UDP-Glc), and uridine diphosphate N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc). The function of most non-canonical caps is unknown, but their presence suggests the existence of a regulatory cap code.
Currently, the complete cap structure can only be identified through bulk methods that cleave caps from their transcripts, thereby losing the link between mRNAs and their specific caps. For NAD-caps enrichment techniques exist that can be followed by sequencing, but no such method exists for other non-canonical caps, and no sequencing method exists that can identify more than one cap. This limitation is a significant obstacle in understanding the cap code and the function of its more enigmatic members.
The objective of this project is to 1) develop a novel single-molecule method that can directly sequence native caps with their full-length RNA transcripts, 2) use this method to characterize the cap-ome across tissues and development, and 3) use the resulting temporal and spatial atlas of capped RNAs to determine the function of non-canonical caps and understand the non-canonical cap code
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka nukleotyd
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2022-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
0313 Oslo
Norwegia
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.