Using deep learning to understand computations in neural circuits with Connectome-constrained Mechanistic Models

Informations projet

DeepCoMechTome

N° de convention de subvention: 101089288

DOI

10.3030/101089288

Date de signature de la CE 15 Mars 2023

Date de début 1 Juillet 2023

Date de fin 30 Juin 2028

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 997 321,00

Contribution de l’UE

€ 1 997 321,00

Coordonné par

EBERHARD KARLS UNIVERSITAET TUEBINGEN
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of Data Management Plan

Publications

Conference proceedings (4)

Inferring stochastic low-rank recurrent neural networks from neural data

Auteurs: Matthijs Pals, A Erdem Sağtekin, Felix Pei, Manuel Gloeckler, Jakob H. Macke
Publié dans: Conference on Neural Information Processing Systems, 2024, ISBN 9798331314385
Éditeur: Curran Associates, Inc.

Latent Diffusion for Neural Spiking Data

Auteurs: Jaivardhan Kapoor, Auguste Schulz, Julius Vetter, Felix Pei, Richard Gao, Jakob H. Macke
Publié dans: Advances in Neural Information Processing Systems, Numéro 38, 2024
Éditeur: Curran Associates, Inc.

Simultaneous identification of models and parameters of scientific simulators

Auteurs: Cornelius Schröder, Jakob H. Macke
Publié dans: PMLR, Numéro 235, 2024
Éditeur: PMLR

All-in-one simulation-based inference

Auteurs: Manuel Gloeckler, Michael Deistler, Christian Weilbach, Frank Wood, Jakob H. Macke
Publié dans: International Conference on Machine Learning, 2024, ISSN 2640-3498
Éditeur: PMLR

Peer reviewed articles (4)

Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types

Auteurs: Yves Bernaerts; Michael Deistler; Pedro J. Gonçalves; Jonas Beck; Marcel Stimberg; Federico Scala; Andreas S. Tolias; Jakob Macke; Dmitry Kobak; Philipp Berens
Publié dans: Patterns, 2023, ISSN 2666-3899
Éditeur: Patterns
DOI: 10.1101/2023.03.02.530774

sbi reloaded: a toolkit for simulation-based inference workflows

Auteurs: Boelts, Jan; Deistler, Michael; Gloeckler, Manuel; Tejero-Cantero, Álvaro; Lueckmann, Jan-Matthis; Moss, Guy; Steinbach, Peter; Moreau, Thomas; Muratore, Fabio; Linhart, Julia; Durkan, Conor; Vetter, Julius; Miller, Benjamin; Herold, Maternus; Ziaeemehr, Abolfazl; Pals, Matthijs; Gruner, Theo; Bischoff, Sebastian; Krouglova, Nastya; Gao, Richard; Lappalainen, Janne; Mucsányi, Bálint; Pei, Felix; Schulz, Auguste; Stefanidi, Zinovia; Coelho Rodrigues, Pedro Luiz; Schröder, Cornelius; Zaid, Faried; Beck, Jonas; Kapoor, Jaivardhan; Greenberg, David; Gonçalves, Pedro; Macke, Jakob
Publié dans: Journal of Open Source Software, 2025, ISSN 2475-9066
Éditeur: The Journal of Open Source Software
DOI: 10.48550/ARXIV.2411.17337

Generating realistic neurophysiological time series with denoising diffusion probabilistic models

Auteurs: Julius Vetter; Jakob H. Macke; Richard Gao
Publié dans: Patterns, Numéro 5(9), 2023, ISSN 2666-3899
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/J.PATTER.2024.101047

Connectome-constrained networks predict neural activity across the fly visual system

Auteurs: Janne K. Lappalainen; Fabian D. Tschopp; Sridhama Prakhya; Mason McGill; Aljoscha Nern; Kazunori Shinomiya; Shin-ya Takemura; Eyal Gruntman; Jakob H. Macke; Srinivas C. Turaga
Publié dans: Nature, Numéro 634, 2024, ISSN 1476-4687
Éditeur: Nature
DOI: 10.15496/PUBLIKATION-102510

Other (1)

Whole-body physics simulation of fruit fly locomotion

Auteurs: Roman Vaxenburg; Igor Siwanowicz; Josh Merel; Alice A. Robie; Carmen Morrow; Guido Novati; Zinovia Stefanidi; Gert-Jan Both; Gwyneth M. Card; Michael B. Reiser; Matthew M. Botvinick; Kristin M. Branson; Yuval Tassa; Srinivas C. Turaga
Publié dans: Nature, 2025
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41586-025-09029-4