Projektbeschreibung
Fortschrittliche native Massenspektrometrie für die Analyse nichtkovalenter Proteinmischungen
Bei der nativen Massenspektrometrie werden Makromoleküle wie intakte Proteine und Proteinkomplexe analysiert. So können die sekundären, tertiären und quartären Strukturen von Biomolekülen charakterisiert werden. Das EU-finanzierte Projekt 2D-TOPMASS verfolgt das Ziel, die Fourier-Transformations-Ionenzyklotronresonanz-Massenspektrometrie (FT-ICR-MS) kombiniert mit Verfahren der Ionenaktivierung mit Ultraviolett- und Infrarotlasern einzusetzen, um die Anwendung der nativen Massenspektrometrie auf große Proteinkomplexe und Protein-/Nukleinsäurekomplexe auszuweiten. Es wird geprüft, inwiefern die Anwendung der nativen Massenspektrometrie in Kombination mit zweidimensionalen Massenspektrometrie-Erfassungsschemata für die Analyse nichtkovalenter Proteinkomplexe und heterogener Mischungen geeignet ist. Das Projekt wird den Einsatz der nativen Massenspektrometrie als leistungsstarkes Verfahren für die Untersuchung von Proteinkomplexen und -ansammlungen in einer Reihe an Proben voranbringen.
Ziel
Native mass spectrometry (MS) is a powerful structural biology tool to study protein complexes, their dynamics, assembly and function. In its so-called top-down approach, it aims to link specific proteoforms to higher assemblies such as non-covalent complexes, in which they function naturally and/or in a disease. The proposed project will leverage the power and versatility offered by state-of-the-art Fourier transform ion cyclotron resonance (FTICR) mass spectrometry coupled to ultraviolet and infrared laser ion activation techniques to advance native top-down MS of large protein- and protein / nucleic acid complexes. Studying a range of protein complexes up to small viral capsids, the project will push the boundaries of FTICR MS in the analysis of high-mass protein complex samples. Utilizing both standard commercially available protein complexes for method setup and benchmarking as well as biologically-relevant FOXO, TEAD and nucleosome protein / DNA complexes from the host laboratory, advanced laser- and electron-induced dissociation and fragmentation techniques and their combinations will be tested to obtain the best possible information on multiple levels of the complexes structure. Finally, the hitherto untried combination of native MS of non-covalent protein complexes with two-dimensional MS acquisition schemes will be explored to probe all species in a heterogeneous mixture at the same time. Linking the obtained sequential information on proteoforms to their complex and subcomplex stoichiometry, this approach will help increase the utility of native MS as a powerful technique for the study of proteoforms and protein assemblies applicable to a broad range of biologically / medically relevant samples promoting and reinforcing the position of native MS in the modern integrative structural biology portfolio as a technique providing information complementary to (and difficult to access by) classical high-resolution approaches.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften theoretische Physik Teilchenphysik Teilchenbeschleuniger
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Optik Laserphysik
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Wir bitten um Entschuldigung ... während der Ausführung ist ein unerwarteter Fehler aufgetreten.
Sie müssen sich authentifizieren. Ihre Sitzung ist möglicherweise abgelaufen.
Vielen Dank für Ihr Feedback. Sie erhalten in Kürze eine E-Mail zur Übermittlungsbestätigung. Wenn Sie sich für eine Benachrichtigung über den Berichtsstatus entschieden haben, werden Sie auch im Falle einer Änderung des Berichtsstatus benachrichtigt.
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
-
HORIZON.4.1 - Widening participation and spreading excellence
HAUPTPROGRAMM
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen -
HORIZON.4.1.5 - Fostering brain circulation of researchers and excellence initiatives
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-WIDERA-2022-TALENTS-02
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
142 00 PRAHA 4
Tschechien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.