Next generation imaging technologies to probe structure and function of biological specimen across scales in their natural context

Informations projet

IMAGINE

N° de convention de subvention: 101094250

DOI

10.3030/101094250

Date de signature de la CE 2 Decembre 2022

Date de début 1 Mai 2023

Date de fin 30 Avril 2028

Financé au titre de

• Research infrastructures

Coût total

€ 9 569 677,52

Contribution de l’UE

€ 9 569 677,50

Coordonné par

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Documents, reports (2)

Publication of project website

Deliverable 44 (also D13.3) is associated with WP13 and pat of Task 13.2: Establish and implement internal and external communication channels (Lead: EMBL-HD; Participants: Euro-BioImaging ERIC, Instruct ERIC)

Report on establishment of Project Management structure and procedures

Deliverable 42 (also D13.1) is associated with WP13 and is part of Task 13.1: Establish and implement the Project Management structure (Lead: EMBL-HD; Participants: Euro-BioImaging, Instruct ERIC, EMBRC ERIC, ESRF, MPG, SU)

Data Management Plan (1)

IMAGINE Data Management Plan

Deliverable 43 (also D13.2) is associated with WP13 and concludes Task 13.1: Establish and implement the Project Management structure (Lead: EMBL-HD; Participants: Euro-BioImaging, Instruct ERIC, EMBRC ERIC, ESRF, MPG, SU)

Publications

Peer reviewed articles (7)

Cryo-plasma FIB/SEM volume imaging of biological specimens

Auteurs: Dumoux, M., Glen, T., Smith, J.L., Ho, E.M., Perdigão, L.M., Pennington, A., Klumpe, S., Yee, N.B., Farmer, D.A., Lai, P.Y. and Bowles, W.
Publié dans: eLife Sciences, Numéro eLife 12:e83623., 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.83623

Plasma FIB milling for the determination of structures in situ

Auteurs: Casper Berger, Maud Dumoux, Thomas Glen, Neville B.-y. Yee, John M. Mitchels, Zuzana Patáková, Michele C. Darrow, James H. Naismith & Michael Grange
Publié dans: Nature Communications, Numéro Article number 629 (2023), 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36372-9

ToMoDL: A model-based deep learning framework for optical projection tomography

Auteurs: Marcos Obando, Andrea Bassi, Nicolas Ducros, Germán Mato, Teresa Correia
Publié dans: Research Square, Numéro Article no. 21735 (2023), 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-47650-3

Serial Lift-Out: sampling the molecular anatomy of whole organisms

Auteurs: Oda Helene Schiøtz, Christoph J. O. Kaiser, Sven Klumpe, Dustin R. Morado, Matthias Poege, Jonathan Schneider, Florian Beck, David P. Klebl, Christopher Thompson & Jürgen M. Plitzko
Publié dans: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7105
Éditeur: Nature Methods
DOI: 10.1038/s41592-023-02113-5

High Throughput Tomography (HiTT) on EMBL beamline P14 on PETRA III

Auteurs: Albers, Jonas, Marina Nikolova, Angelika Svetlove, Nedal Darif, Matthew J. Lawson, Thomas R. Schneider, Yannick Schwab, Gleb Bourenkov, and Elizabeth Duke
Publié dans: Journal of Synchrotron Radiation, Numéro Volume 3, Part 1, 2024, ISSN 1600-5775
Éditeur: Journal of Synchrotron Radiation
DOI: 10.1107/S160057752300944X

Colour science with lasers, gummy bears, and rainbows (educational paper)

Auteurs: Rute C. Félix, David Paleček, Teresa M. Correia
Publié dans: Science in School: The European Journal for Science Teachers Numéro 66, Numéro Numéro 66, 2024, ISSN 0140-5284
Éditeur: Science in School: The European Journal for Science Teachers
DOI: 10.5281/zenodo.10608950

Model-based deep learning framework for accelerated optical projection tomography

Auteurs: Marcos Obando, Andrea Bassi, Nicolas Ducros, Germán Mato & Teresa M. Correia
Publié dans: Nature - Scientific Reports, Numéro Article no. 21753 (2023), 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-47650-3

Other (1)

EasyGrid: A versatile platform for automated cryo-EM sample preparation and quality control

Auteurs: Olivier Gemin, Victor Armijo, Michael Hons, Caroline Bissardon, Romain Linares, Matthew W. Bowler, Georg Wolff,, Kirill Kovalev, Anastasiia Babenko, Veijo T. Salo, Sarah Schneider, Christopher Rossi, Léa Lecomte, Thibault Deckers, Kévin Lauzier, Robert Ja
Publié dans: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: Biorxiv
DOI: 10.1101/2024.01.18.576170