Projektbeschreibung
Die Beobachtung großer biomolekularer Assemblierungen mit kernmagnetischen Resonanzspektroskopie verbessern
Trotz der Fortschritte im Bereich der kernmagnetischen Resonanz (NMR) sind der Untersuchung großer biomolekularer Assemblierungen aufgrund von Signalüberschneidungen, geringer Empfindlichkeit und Linienverbreiterung Grenzen gesetzt. Das ERC-finanzierte Projekt XXL-NMR zielt daher auf die Entwicklung von Methoden ab, die NMR-Spektren und die damit verbundene ortsspezifische Analyse vereinfachen. Zunächst wird eine ortsspezifische Markierungsmethode entwickelt, die die Beobachtung von NMR-Signalen für anvisierte Stellen in großen Proteinen ermöglicht. Außerdem soll eine kombinatorische Strategie entwickelt werden, um den Zeitaufwand für die ortsspezifische Identifizierung einzelner NMR-Signale zu verkürzen. Es werden neue NMR-Experimente entwickelt, damit sowohl die Auflösung als auch die Empfindlichkeit von NMR-Spektren sehr großer Komplexe verbessert werden kann. Schließlich werden diese neuen NMR-Methoden an großen biologischen Komplexen wie therapeutischen Antikörpern und Ribosomen demonstriert.
Ziel
The cell is a collection of dynamic molecular machines. NMR spectroscopy is the method of choice to observe, at atomic resolution, complex conformational changes, transient interactions and dynamics of proteins. Introduction of methyl specific labelling technology has enabled solution NMR studies of protein assemblies of several hundred kDa. However, this strategy is mostly restricted to symmetrical and thermostable protein assemblies, precluding applications to large medically relevant biological complexes. The increases of linewidths and the high number of signal overlaps hamper the NMR spectra analysis of most hetero-oligomeric large assemblies studied at room temperature. In this project, we will develop two complementary concepts to significantly simplify both NMR spectra and corresponding site specific analysis. We will build a multi-site specific labelling method enabling observation of NMR signals only for the sites of interest in a large protein complex. We will invent a combinatorial strategy to reduce the time required for site-specific identification of each individual NMR signal from a few months to a few hours. New 1H-frequencies edition schemes will be introduced to enhance significantly the NMR spectras resolution of very slow tumbling biological particles. These groundbreaking NMR methods will be validated using therapeutic antibodies (150 kDa), ribosome (2.4 MDa) samples, and will be used directly to capture the mechanisms of ATP-fueled human chaperonin (1 MDa) in complex with the aggregation prone form of Huntingtin. This project will provide new technological breakthroughs to push biological applications of NMR significantly beyond its current boundaries. We anticipate that the simplification of the NMR analysis resulting from the new developed NMR routes will transform the solution NMR spectroscopy in a very competitive method to study large medically relevant biomolecular assemblies and molecular machines, so far considered as untargetable.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Optik Spektroskopie
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2022-ADG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
75794 PARIS
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.