Description du projet
Plasticité développementale: le rôle non conventionnel des facteurs de transcription
À l’instar d’une serrure et d’une clé qui ouvrent une porte située à plusieurs pâtés de maisons, les éléments amplificateurs éloignés des gènes qu’ils régulent lient les facteurs de transcription (FT) pour réguler la transcription des gènes. Mais que se passerait-il si la «clé», le facteur de liaison du FT, était toujours liée et que son rôle n’était pas l’activation directe de l’amplificateur? Le projet SENCE, financé par le CER, se penchera sur cette question dans le contexte de la régulation de la différenciation des cellules souches embryonnaires par la kinase liée au signal extracellulaire (ERK). L’équipe a découvert que la régulation de l’amplificateur dans la signalisation ERK ne se produit pas avec des FT, qui au contraire bloquent l’activation future. Le projet examinera la nature fondamentale de l’activité des amplificateurs et déterminera si la dissociation de la régulation transcriptionnelle et de la liaison des FT sous-tend la plasticité développementale.
Objectif
Transcription is regulated by transcription factors (TFs) bound at enhancer elements located long-distances from the genes they regulate. How does this account for dynamic responses to the environment via signaling? Canonical views invoke signal induced changes in TF expression/modification or cofactor localization, but here we suggest that TF occupancy could be present before and after the signal, establishing competence, ensuring plasticity and blocking premature commitment. For ERK signaling, a central regulator of embryonic stem cell (ESC) differentiation, we found enhancers were regulated via selective recruitment of RNA Polymerase II (RNAPII) and associated cofactors. In this case, TFs do not play a direct role in enhancer regulation, but safeguard future activation in response to changes in signaling. In the context of developmental biology this paradigm could explain the dynamic nature of cell specification in the early mammalian embryo. In this proposal, we seek to understand enhancer specific regulation by ERK, exploit our ability to manipulate ERK to disentangle mechanism and focus on preimplantation development to explore how these phenomena explain plasticity. To circumvent heterogeneity created by feedback inhibition we developed a unique ESC line for cell intrinsic and synchronous ERK induction. We combine these ESCs with rapid TF degradation mutants to isolate homogeneous cell states that can be exploited to generate unique datasets and identify key factors within ERK response. We address how coactivator phosphorylation promotes selective recruitment of Mediator/RNAPII, explore the fundamental nature of enhancer activity and ask how uncoupling of transcriptional regulation from TF binding underpins developmental plasticity. By exploiting our capacity to modulate enhancer activity via signaling, we not only address how signaling regulates transcription to drive differentiation choices, but how enhancers themselves regulate gene expression.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire signalisation cellulaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine clinique embryologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1165 KOBENHAVN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.