Descripción del proyecto
Un método innovador para cartografiar las modificaciones epigenéticas en el genoma de mamíferos
Las modificaciones epigenéticas de la base nucleotídica citosina en la secuencia CpG en los genomas de mamíferos son fundamentales para la regulación de la expresión génica y el diagnóstico del cáncer. Sin embargo, los métodos actuales no son capaces de revelar la combinación cuando estas modificaciones se producen en ambas cadenas de un ADN bicatenario. En el proyecto COMBICODE, financiado con fondos europeos, se desarrollarán y comercializarán dos nuevos equipos de cartografiado de las importantes modificaciones bicatenarias de CpG consistentes en la 5-metilcitosina y la 5-hidroximetilcitosina para la investigación epigenética y la biopsia líquida. El equipo del proyecto aprovechará las sondas de enriquecimiento por afinidad desarrolladas previamente para el análisis selectivo de las nuevas modificaciones bicatenarias de CpG, integradas en equipos de cartografiado genético fáciles de usar.
Objetivo
In mammalian genomes, epigenetic modifications of the nucleobase cytosine occur in both strands of the DNA duplex in the sequence CpG, and they are central regulators of gene expression as well as important cancer biomarkers. However, current analytical techniques cannot reveal the combination in that these modifications occur in the two strands of a DNA duplex. The resulting inability to create genomic maps of these CpG duplex modifcations represents a major roadblock for future developments in epigenetics research and cancer diagnosis. We have engineered the first affinity enrichment probes for selectively analysing novel CpG duplex modifications, and integrated them into user-friendly and cost-effective kits for genomic mapping. In this project, we will develop and commercialize two kits for mapping of the most important novel CpG duplex modification consisting of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine for the epigenetics research and the liquid biopsy markets. This will provide decisive new impulses for epigenetics research as well as for cancer biomarker discovery and liquid biopsy, both large and rapidly growing markets.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Programa(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept GrantsInstitución de acogida
44227 Dortmund
Alemania