Description du projet
Une approche innovante pour cartographier les modifications épigénétiques dans le génome des mammifères
Les modifications épigénétiques de la nucléobase cytosine dans la séquence CpG des génomes de mammifères sont essentielles pour la régulation de l’expression des gènes et le diagnostic du cancer. Cependant, les méthodes actuelles ne permettent pas de révéler la combinaison lorsque ces modifications surviennent dans les deux brins d’un duplex d’ADN. Le projet COMBICODE, financé par l’UE, développera et commercialisera deux nouveaux kits destinés à cartographier les modifications importantes des duplex CpG constitués de 5-méthylcytosine et de 5-hydroxyméthylcytosine pour la recherche en épigénétique et la biopsie liquide. Le projet s’appuiera sur les sondes d’enrichissement par affinité déjà développées pour l’analyse sélective des nouvelles modifications des duplex CpG, intégrées dans des kits conviviaux pour la cartographie du génome.
Objectif
In mammalian genomes, epigenetic modifications of the nucleobase cytosine occur in both strands of the DNA duplex in the sequence CpG, and they are central regulators of gene expression as well as important cancer biomarkers. However, current analytical techniques cannot reveal the combination in that these modifications occur in the two strands of a DNA duplex. The resulting inability to create genomic maps of these CpG duplex modifcations represents a major roadblock for future developments in epigenetics research and cancer diagnosis. We have engineered the first affinity enrichment probes for selectively analysing novel CpG duplex modifications, and integrated them into user-friendly and cost-effective kits for genomic mapping. In this project, we will develop and commercialize two kits for mapping of the most important novel CpG duplex modification consisting of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine for the epigenetics research and the liquid biopsy markets. This will provide decisive new impulses for epigenetics research as well as for cancer biomarker discovery and liquid biopsy, both large and rapidly growing markets.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturellessciences biologiquesgénétiqueADN
- sciences médicales et de la santémédecine cliniqueoncologie
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Programme(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-POC2
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HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept GrantsInstitution d’accueil
44227 Dortmund
Allemagne