Descripción del proyecto
Biomarcadores para neoplasias hemáticas
La modificación epigenética de los residuos de citosina en el ADN indica la modulación de la transcripción génica. La 5-hidroximetilcitosina (5hmC) forma parte del primer paso para eliminar la marca de silenciamiento genético de la 5-metilcitosina (5mC) y puede servir como biomarcador de enfermedades. El objetivo del proyecto BASE6, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, es desarrollar un chip de ADN para el análisis de la distribución de la 5hmC en la salud y la enfermedad. La plataforma generada se comercializará a un precio bajo y se espera que fomente la investigación para el descubrimiento de biomarcadores del cáncer y otras enfermedades. A largo plazo, la tecnología de BASE6 se empleará tanto en el diagnóstico como en el seguimiento del tratamiento de enfermedades.
Objetivo
5-hydroxymethylcytosine (5hmC) is an oxidized form of 5-methylcytosine (5mC). It is the first step of reversing DNA methylation and an important indicator of dynamic epigenetic changes in genomic DNA. One characteristic of cancerous transformations is dramatic modulation of the epigenomic landscape. Consequently, changes in the distribution of 5hmC have been shown to correlate with a broad range of cancers and is potentially a powerful disease biomarker. Nevertheless, existing methods for mapping 5hmC are complex and expensive thus hindering the translation of 5hmC research into clinical use. This project aims at developing a custom DNA chip for 5hmC that will allow cost-effective and targeted analysis of disease biomarkers. We will use our patented procedure for direct fluorescent labeling of 5hmC in combination with commercially available genome-wide microarrays to create maps of 5hmC distribution in health and disease. These large-scale arrays will be used in the discovery phase to identify cancer biomarkers. In the second phase, only the subset of genomic loci that contain medically significant modulation in 5hmC will be used to design and print a custom microarray containing only the relevant probes. This concept predicts a cost reduction of 10-100 fold which will remove the barriers for large scale research and high volume testing. Disease specific diagnostic chips are attractive products with direct impact on society and economy via promoting more accessible testing and patient management. Our preliminary results indicate that we will be able to offer a universal platform for even the most challenging samples including cell-free DNA analysis from liquid biopsies. We envision it as an enabling technology for 5hmC research, biomarker discovery and companion diagnostics for guiding and monitoring therapy.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Programa(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Régimen de financiación
ERC-POC - Proof of Concept GrantInstitución de acogida
69978 Tel Aviv
Israel