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Revealing plasticity of developmental cell fate decisions by single-cell RNA labelling

Obiettivo

Every time an egg is fertilised, the cellular diversity of an animal must be rebuilt from scratch. Therefore, a central question in developmental biology is how cells differentiate to acquire distinct fates. A combination of genetics, molecular biology, and microscopy approaches has led to fundamental discoveries. Recently, single-cell genomics has enabled the analysis of transcriptional differentiation trajectories at unprecedented scale and resolution. However, ordering single cells by transcriptome similarity only gives ensemble averages of differentiation trajectories and not the full spectrum of cell state transitions. It then remains unclear whether cells can commit to their fate at different stages of development or change differentiation trajectories. The sc-LAB2FATE project proposes to measure how single-cell transcriptomes change over time in living zebrafish embryos using a new RNA labelling methodology. This will reveal the full spectrum of differentiation trajectories during gastrulation, allowing to see not only the major routes of differentiation, but also rare alternative trajectories. Single-cell RNA labelling, biochemical nucleoside conversion and sequencing will be used to measure mRNA kinetics and transcriptome dynamics of zebrafish embryos at single-cell resolution. Spontaneous cell fate changes during normal development will be contrasted with induced cell fate changes upon cell transplantation from different cell types to decipher signalling interactions. This project will leverage single-cell genomics and traditional approaches in developmental biology to build a conceptual framework for analysing embryonic development as both a genetically programmed and a self-organised phenomenon, and to provide a general blueprint of how one can study perturbation response using metabolic labelling in living systems.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

MAX DELBRUECK CENTRUM FUER MOLEKULARE MEDIZIN IN DER HELMHOLTZ-GEMEINSCHAFT (MDC)
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 189 687,36
Indirizzo
ROBERT ROSSLE STRASSE 10
13125 Berlin
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Berlin Berlin Berlin
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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