Descrizione del progetto
Caratterizzazione di nuovi metaboliti prodotti dai licheni in ambienti naturali
I microbi isolati rappresentano solo una piccola percentuale della diversità microbica dell’ambiente naturale. Sebbene il loro studio abbia portato a composti interessanti e urgentemente necessari per nuovi farmaci antimicrobici, la scoperta di tali composti è diminuita negli ultimi decenni. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto FungalHetEx studierà i licheni, una comunità microbica che comprende funghi, alghe verdi, cianobatteri e batteri. Un recente studio ha sfruttato le tecnologie ad alto rendimento e le analisi multiomiche al fine di facilitare l’impegnativo studio dei licheni nel loro ambiente naturale. Partendo da queste conoscenze, FungalHetEx intende applicare tecniche di biotecnologia sintetica, bioinformatica, chimica e microbiologia per caratterizzare i nuovi metaboliti prodotti dalla simbiosi nelle comunità di licheni.
Obiettivo
The increases in antimicrobial resistance and infections caused by microbes, such as mucormycosis (black fungus disease) on Covid-19 patients, highlight the urgent need for new antimicrobial drugs. Most drugs approved for clinical use are based or inspired by natural products. The recurrent re-discovery of compounds when studying isolated microbes, declined the research on natural products in the last decades. However, isolated microbes represent a small percentage of the true microbial diversity living in the environment. Lichens are a microbial community formed by different partners (fungi, green algae, cyanobacteria, bacteria) and their metabolites present diverse biological activities including antimicrobial. Furthermore, many of these molecules have vibrant colours and can be used as natural colorants. Due their slow growth and difficulties in the laboratory cultivation, little is known about natural products biosynthetic genes of the multiple partners living in symbiosis. The improvement in high-throughput technology and the current affordable prices for multi-omics analysis (meta-genomics, -transcriptomics and -bolomics), are allowing a deeper study on natural environmental samples. This project aims to use the knowledge obtained in a recent multi-omics study and apply synthetic biotechnology, bioinformatics, chemistry and microbiology techniques to study novel metabolites from lichen. Polyketide synthase biosynthetic gene clusters have been selected and they will be cloned, transformed and heterologously expressed using Aspergillus oryzae. The optimisation of the polyketides biosynthesis by the heterologous host will be performed and different fermentation conditions will be tested. Novel molecules will be chemically and biologically characterized. During FungalHetExt, I will study novel molecules produced under symbiosis using a multidisciplinary approach with the focus to discovery new molecules and improve my science communication and leadership skills.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. La classificazione di questo progetto è stata convalidata dal team del progetto.
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- scienze naturaliscienze biologichemicrobiologiamicologiaetnolichenologia
- scienze naturaliscienze biologichemicrobiologiabatteriologia
- scienze naturaliscienze biologichebiologia sintetica
- scienze naturaliscienze biologichebiologia cellularemetabolismo cellulare
- scienze mediche e della salutemedicina di basefarmacologia e farmaciafarmacoresistenzaresistenza agli antibiotici
Parole chiave
Programma(i)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
Vedi altri progetti per questo bandoMeccanismo di finanziamento
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -Coordinatore
1011 JV AMSTERDAM
Paesi Bassi