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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Including intraspecific diversity of eDNA analyses to develop a new holistic approach for Environmental Status Assessments of the benthic deep-sea

Description du projet

Analyse de l’ADN environnemental pour l’évaluation de l’environnement benthique des grands fonds

Quantifier l’impact de l’homme sur les systèmes marins est crucial, mais l’évaluation du biome des grands fonds pose des problèmes. L’analyse de l’ADN environnemental n’est pas encore prête pour une intégration politique. Le projet HaploSEA, soutenu par le programme Actions Marie Sklodowska-Curie, évalue les communautés benthiques des grands fonds par le biais de la diversité méta-génétique. Le projet effectuera des analyses approfondies de métabarcodage des bactéries, des archées, des eucaryotes unicellulaires et des métazoaires afin d’explorer les variations spatiales et temporelles naturelles dans des communautés entières. L’hybridation permettra de recueillir du matériel génétique en vue d’une reconstruction complète des gènes, et des sondes spécifiques pour les groupes d’indicateurs biotiques seront développées. Le projet s’appuiera sur la base de données de métabarcodage eDNAbyss d’Ifremer, échantillonnera les grands fonds le long d’un gradient de perturbation en utilisant une technologie sous-marine avancée, évaluera les approches et proposera leur application pour les évaluations environnementales.

Objectif

Measuring anthropogenic impacts on marine systems is of significant interest to stakeholders across the globe. Yet, assessing the ecological status of deep-sea habitats, the earth's largest biome, is challenging. Implementing environmental DNA analysis into environmental policy is desired and timely but not yet ready. HaploSEA is evaluating the use of meta-genetic diversity for biological assessments of deep-sea benthic communities. These include four novel approaches: (I) Performing holistic metabarcoding analyses including bacteria and archaea, unicellular eukaryotes, and metazoans to analyze natural spatial and temporal variability of entire communities. (II) Including haplotype diversity as a new parameter to describe ecosystems. (III) Establish a generic protocol to define genetic indicator groups based on their intraspecific diversity. (IV) Including capture by hybridization, a novel method for full gene reconstruction, and designing specific capture probes for biotic indicator groups of cyanobacteria, foraminifera, and nematodes. For analyses, we will benefit from a unique metabarcoding database (eDNAbyss, Ifremer) with global coverage and 1500 samples from all ocean basins, which are standardized, analyzed, and processed for five-gene regions. Using state-of-the-art underwater technology, we will sample in the deep sea along a disturbance gradient to collect samples for analysis via the above novel approaches. Finally, I will evaluate the suggested approaches and outline their future use for meta-genetic environmental assessments. HaploSEA is an interactive and multidisciplinary project combining expertise and facilities at top European institutes in deep-sea marine science (Ifremer, GEOMAR, and MARUM). This setup combines specialists from different fields, technical backgrounds, and taxonomic groups to share different perspectives and novel approaches.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

HELMHOLTZ-ZENTRUM FUR OZEANFORSCHUNG KIEL (GEOMAR)
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 173 847,36
Adresse
WISCHHOFSTRASSE 1-3
24148 Kiel
Allemagne

Voir sur la carte

Région
Schleswig-Holstein Schleswig-Holstein Kiel, Kreisfreie Stadt
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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