Projektbeschreibung
Mit DNS-Umweltanalytik benthische Tiefseegemeinschaften bewerten
Die Messung der Auswirkungen des Menschen auf marine Systeme ist von zentraler Bedeutung, aber die Bewertung des Tiefsee-Bioms stellt eine Herausforderung dar. Die Durchführung von DNS-Umweltanalytik ist noch nicht für die Politikvernetzung vorbereitet. Das Ziel des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts HaploSEA besteht darin, benthische Tiefseegemeinschaften anhand metagenetischer Vielfalt zu beurteilen. Im Rahmen des Projekts werden gründliche Metabarcoding-Analysen von Bakterien, Archaeen, einzelligen Eukaryoten und Metazoen durchgeführt, um natürliche räumliche und zeitliche Variationen ganzer Gemeinschaften zu erkunden. Mithilfe von Hybridisierung wird genetisches Material für eine vollständige Genrekonstruktion erfasst, und es werden spezifische Sonden für biotische Indikatorgruppen entwickelt. Projektintern werden die eDNAbyss-Metabarcoding-Datenbank von Ifremer genutzt, die Tiefsee entlang eines Störungsgradienten mittels fortgeschrittener Unterwassertechnologie beprobt, die Ansätze bewertet und deren Anwendung für Umweltbewertungen vorgeschlagen.
Ziel
Measuring anthropogenic impacts on marine systems is of significant interest to stakeholders across the globe. Yet, assessing the ecological status of deep-sea habitats, the earth's largest biome, is challenging. Implementing environmental DNA analysis into environmental policy is desired and timely but not yet ready. HaploSEA is evaluating the use of meta-genetic diversity for biological assessments of deep-sea benthic communities. These include four novel approaches: (I) Performing holistic metabarcoding analyses including bacteria and archaea, unicellular eukaryotes, and metazoans to analyze natural spatial and temporal variability of entire communities. (II) Including haplotype diversity as a new parameter to describe ecosystems. (III) Establish a generic protocol to define genetic indicator groups based on their intraspecific diversity. (IV) Including capture by hybridization, a novel method for full gene reconstruction, and designing specific capture probes for biotic indicator groups of cyanobacteria, foraminifera, and nematodes. For analyses, we will benefit from a unique metabarcoding database (eDNAbyss, Ifremer) with global coverage and 1500 samples from all ocean basins, which are standardized, analyzed, and processed for five-gene regions. Using state-of-the-art underwater technology, we will sample in the deep sea along a disturbance gradient to collect samples for analysis via the above novel approaches. Finally, I will evaluate the suggested approaches and outline their future use for meta-genetic environmental assessments. HaploSEA is an interactive and multidisciplinary project combining expertise and facilities at top European institutes in deep-sea marine science (Ifremer, GEOMAR, and MARUM). This setup combines specialists from different fields, technical backgrounds, and taxonomic groups to share different perspectives and novel approaches.
Wissenschaftliches Gebiet
Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigenFinanzierungsplan
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordinator
24148 Kiel
Deutschland